Team:Chiba/protocol/j

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形質転換

 * 形質転換（通称：トラフォ）とは？
 * 外部からDNAを加えて、その生物の性質を変える操作のことです.
 * アイジェムチバ2008では、XL10GOLD，BW35113，などの大腸菌株を使用しています.

Z コンピ
Z-Competentcellsを使った形質転換のプロトコル.

エレクトロポレーション
アイジェムチバ2008では使用履歴なし.

DNA精製

 * DNA精製（通称：ミニプレ）とは？
 * スモールスケールで生物からプラスミドを精製することです.

シグマプレップ
Sigma Miniprep kit によるDNA精製プロトコル

キアプレップ
QIAprep Spin Miniprep kit によるDNA精製プロトコル

ザイモDNAクリーン
ライゲーション過程などで必要不可欠なザイモクリーンのプロトコルです.

アガロースゲル電気泳動

 * アガロースゲル電気泳動（通称：ゲル電）とは？
 * DNAを分離する手法のことです.
 * さまざまな実験操作後で、DNAの長さを確認する際によく使います. またライゲーションのためのゲル抽出の際にも行う操作です.
 * 経験を積むほど素敵なゲルを作成することができます. 職人の知恵と力量が試されます. 簡単に言うときれいなゲルほど良いバンドがでるんです.

アガロースゲル電気泳動
アガロースゲル作成から、DNAバンド観察までのプロトコルです.

ポリメラーゼ連鎖反応

 * ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）とは？
 * DNAを増幅させる手法のことです.
 * これを使えばたったの2時間で目的の部分のDNAを増幅させることができます.

PCR
卓上型PCR装置を使ったPCR法のプロトコルです.

ダイジェスチョン
DNAを制限酵素によって切断します. ライゲーションやDNAの長さを確認するために必要不可欠な操作です.

ゲル抽出
アガロースゲル電気泳動後にそのゲルからDNAを抽出する操作です.

DNA脱リン酸化

 * SAP(Shrimp Alkaline Phosphetase)処理とは？
 * Self ligationなどの目的以外のサイト同士の結合も、リン酸基が残っているとおきてしまいます. これらの反応は少なくともligation反応を阻害する反応です. 特にベクターだけのSelf ligationは目的のDNAが含まれていなくても、oriやマーカーがDNAに含まれているため、菌内で増殖し、かつ、抗生物質も効かないプラスミドができてしまいます.
 * これを防ぐためにベクター側のリン酸基を処理しようというのが、ここで紹介するプロトコルになります.

DNAリン酸化
アイジェムチバ2008では未使用.

ライゲーション
ダイジェスチョンなどで作成した複数のDNA断片を組み替えてつなげる操作です.