Team:Chiba/Calendar-Main/28 September 2008

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ミーティング
参加者：井山、川崎、香取、小林、杉山、冨永、福冨

時間：11:00-14:00 @一号棟ゼミ室

イントロと現状把握-実験デザイン

 * 対時計の時間に合わせた、生物タイマー
 * 1) デモ-可能
 * 2) 現状で足りない要素-使い道は？


 * 時限装置
 * 1) デモ-不可
 * 2) 現状で足りない要素-AND gate使わなければならない.


 * シークエンス制御デバイス（自動的に順番にスイッチが切り替わるデバイス）
 * 1) デモ-可能
 * 2) 現状で足りない要素-レシーバを変えて実験-->発現していない-->mutLuxRの作成.

決まったこと
タイトル案
 * 1) E.Coli Time Keeper
 * 2) E.Coli Time Manager

Description
 * 生物タイマー/シークエンス制御デバイスどちらにも触れるように書く.
 * シークエンシャルに制御されているデバイスを探す. 先生に相談.

田代さんより
タイマーに対して
 * ラクトースを入力にすることはできないか.
 * 現在、AHL合成回路は、lacプロモータに制御されているため、IPTGを添加することで起動する. しかし、IPTGは分解されない.


 * ラクトースも、lacプロモータを起動することができる. その上、代謝される分子である. ラクトースを入力として用いれば、一度目の入力（ラクトース添加、閾値濃度の半分）ではONにならなかった受信装置（luxR-plux-GFP）が、二回目の入力（一回目と等量のラクトース添加）で初めてONになる仕組みが実現できるのでは.


 * この場合の実験デザイン
 * 1) ラクトースが代謝されること、またそれがどの程度であるのか、を確認.
 * 2) 今までのtime-delay実験において、IPTGをラクトースに変えて実験してみる. この際、ラクトース濃度を何通りかに変えて、gfpによる蛍光強度を測定する.
 * 3) 蛍光が見られるぎりぎりのラクトース濃度が知れたら、その1/2のラクトースを、二回に分け添加. 二回目の添加で初めてgfpがONになることを確認する. -->AHLが蓄積していることを確認.

シークエンス制御デバイスに対して
 * AHL-~R複合体の、プロモータに対する親和性を変えてみたらどうか.