Team:Chiba/BS3



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6月のブレインストーミングのログです.

ブレインストーミングが細分化してきたので、記録係ですべて補うのは不可能です.

ブレインストーミングを行ったら各自がここにまとめて掲載していってください.

よろしくお願いします.

4/5/6/7月

【アドバイス内容】6/12（木）
記録者：福冨浩樹

色系積分

意見


 * 視覚的に確認


 * 抽出して色素を確認、数値化する.


 * 余り増えすぎると、色素を作らない・・・？


 * カロテノイド・・・見えやすいからお勧め

ルシメラーゼ・・・たまらない→使えないね


 * 放出できればダイナミックレンジが広がるのではないか？


 * 段階によって色を変える→Phaseごとに分ける


 * 感度ごとに色を分けて、3段階とか！

問題点


 * 菌が増えると感度が上がるので、積分できない→補正できればいい?


 * 色素だとダイナミックレンジ３H~10H

スイッチの切れが良くないといけませんね！

運動系

意見


 * 視覚化をどうすればいいのか


 * まっすぐはしらせなくちゃいけない

キャピラリーやマイクロ流路で一次元にすれば可能か 上手に濃度勾配

問題点

時間がかかる

利用法

光、熱、酸素などをすべてHSL出力に変換⇒積分で賞味期限マーカー

【第23回ブレインストーミング】6/14（土）
記録者：

【第24回ブレインストーミング】6/16（月）
記録者：

【第25回ブレインストーミング】6/19（木）
記録者：

【第26回ブレインストーミング】6/23（月）
記録者：杉山まい

積分菌をビーズに載せ、AHLを出している感知菌の中を通る. 積分菌はビーズとともに進んでいくため通ったときのAHL量が変わる. その変化を色素として表現していく. AHLが拡散しないように感知菌はAiiAも同時に出し、調節する.
 * 福冨案

感知→積分　　で終わらせるのではなく、
 * その他

感知→積分→感知　　　として積分値を次へのinputのようなものにできないか？

【第27回ブレインストーミング】6/25（水）
記録者：

【第28回ブレインストーミング】6/26（木）
記録者：杉山まい


 * 福冨案

感知菌（sender)：inputの量に応じてAHLをだす.

積分菌（reciever）:AHLを受け取り、AIP合成→外に放出
 * AIPがたまり、閾値（しきいち）を超える＝リボスイッチがオン、inducer合成（他の積分菌へ）

積分菌について
 * AIPへの感知をにぶらせる. →threshold
 * indecer→低分子（膜外に出すため）で、生体内合成可なもの
 * cross talkしないようにする



【第29回ブレインストーミング】6/27（金）
記録者：

【企画内容中間発表＆第30回ブレインストーミング】6/28（土）
記録者：杉山まい 大腸菌にビーズ（磁石にひきつけられる）をつけておく. 各大腸菌に単位時間ごとの入力を感知させる. ビーズに乗った大腸菌は磁力に引っ張られて一定の速度で進んでいる. 感知終了後、大腸菌はビーズから離れ、その場にとどまる. output（色素）の濃淡により積分を行っていく.
 * 川崎＆香取案


 * 単位時間ごとに行う利点→ダイナミックレンジ解消（色素の濃淡の限界を解消）
 * 磁石の使用理由→単位時間ごとの大腸菌の区別が容易


 * ・問題点・・・単位時間ごとにどう区切るのか？
 * どのように感知するのか？

後日、グラフを載せて説明したいと思います.

遺伝子回路の中で積分を利用できないか？（構想中）
 * 小林案