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Team:Chiba/Reference/j
From 2008.igem.org
UV response
- Julianne Forman et al.:Photobiological and thermal effects of photoactivating UVA light doses on cell cultures.Photochem. Photobiol. Sci., 2007, 6, 649–658,649
ヒーラ細胞（ヒト由来細胞株）にUVAを照射(23.85 J cm−2まで)して、レスポンス(アポトーシス)を見ている。また、7.6 J cm−2(for the GreenSpot photocuring system)と、2.52 J cm−2(for the BlakRay lamp)の二種類光を照射 - Jaime L. Matta et al.:Environmental UV-A and UV-B Threshold Doses for Apoptosis and Necrosis in Human Fibroblasts.Photochemistry and Photobiology,2005,81,563–568
Bacterial Communication
- [http://www3.interscience.wiley.com/journal/118512088/abstract L. Steindler.V.Venturi.:Detection of quorum sensing N-acyl homoserine lactone signal molecules by bacterial biosensors.FEMS Microbiol Lett 266 (2007) 1-9L].
クオラムセンシングを利用したAHLバイオセンサーについてのミニレビュー。クオラムセンシングのクロストークについて、Table 1.に情報あり。 - [http://www3.interscience.wiley.com/journal/119124142/abstract M.K Winson et al.:Construction and analysis of luxCDABE-based plasmid sensors for investigating N-acyl homoserine lactone-mediated quorum sensing.FEMS Microbiology Letters 163 (1998) 185-192]
Figure 2.hは、LuxR、RhlR、LasRそれぞれの、C4-C14のN-acyl-L-homoserine lactone,C4-C14のN-(3-oxoacyl)-L-homoserine lactoneに対する感受性を比較したグラフ。 - [http://www.pnas.org/content/100/suppl.2/14549.full Michiko E. Taga. Bonnie L.Bassler.:Chemical communication among bacteria.PNAS.November 25, 2003,100.suppl.2]
クオラムセンシングについての総説。アシル基の異なるAHL、およびそのシンターゼの紹介、AIPを用いたコミュニケーション、AiiA（AHL分解酵素）についてのまとめがある。 - [http://jb.asm.org/cgi/content/abstract/176/10/3076 K.M.GRAY et al.Interchangeability and Specificity of Components from the Quorum-Sensing Regulatory Systems of Vibrio fischeri and Pseudomonas aeruginosa.J.BACTERIOL.176,1994,3076-3080]
LasとLuxのクロストークについて調べた論文。Table 1とTable 2で、promotor、レセプタータンパク質、インデューサーそれぞれを交換して、レポーターの発現の様子を調べている。 - [http://www.nature.com/msb/journal/v4/n1/full/msb200824.html FK Balagadde et al.:A synthetic Escherichia coli predator–prey ecosystem.Molecular Systems Biology 4:187,2008]
LuxとLasによるクオラムセンシングを利用した、プレデター・プレイモデル。LuxとLasのクロストークについて言及あり。 - [http://www.nature.com/nature/journal/v417/n6892/abs/nature00833.html Rong-guang Zhang et al.:Structure of a bacterial quorumsensing transcription factor complexed with pheromone and DNA.NATURE 417,2002,971-974]
LuxR-familyタンパク質のTraR(Agrobacterium tumefaciens)の構造について、詳細な記述がある。 - [http://www.pnas.org/content/104/44/17300.abstract K. Brenner et al.:Engineered bidirectional communication mediates a consensus in a microbial biofilm consortium.PNAS.2007.104.no.44.17300–17304]
LasI/R,RhlI/Rを用いたMicrobial Consensus Consortium (MCC) responseについて。supporting information (SI) Fig. 6に、LasとRhlのクロストークを調べたグラフ。 - [http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/sci;272/5268/1655 Margret I. Moré et al.:Enzymatic Synthesis of a Quorum-Sensing Autoinducer Through Use of Defined Substrates.PNAS.1996.272.1655-1658.]
TraIのkineticsについての記述あり。 - [http://arjournals.annualreviews.org/doi/abs/10.1146/annurev.micro.55.1.165?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org&rfr_dat=cr_pub%3dncbi.nlm.nih.gov Melissa B. Miller and Bonnie L. Bassler.:QUORUM SENSING IN BACTERIA.annurev.micro.55.1.165.2001]
クオラムセンシングについての総説、各論。シュードモナスのクオラムセンシングについての記述あり-->LasとRhlが機能する仕組みについて図つきで解説あり。 - [http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=38458 A. L. SCHAEFER et al.:Generation of cell-to-cell signals in quorum sensing:Acyl homoserine lactone synthase activity of a purified Vibrio fischeri LuxI protein.PNAS.93, pp. 9507, September 1996,Biochemistry]
LuxIのkineticsについて、など。LuxIは20~30℃で最大に近い活性を示、18℃では最大活性の57%、37℃では最大活性の10%となってしまうらしい。 - [http://www.pnas.org/content/96/8/4360.abstract M. R. PARSEK et al.: Acyl homoserine-lactone quorum-sensing signal generation.PNAS.96.pp.4363.1999.Biochemistry]
RhlIのkineticsなど、について。50℃において、37℃の場合の2倍の活性を示し、活性を示す最大温度は60℃付近までであるらしい。
- [http://aem.asm.org/cgi/content/abstract/67/2/575 ANDERSEN et al.:gfp-Based N-Acyl Homoserine-Lactone Sensor Systems for Detection of Bacterial Communication.Vol. 67, No. 2.575–585.2001.APPL. ENVIRON. MICROBIOL.]
