Team:Chiba/jk/β

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Revision as of 01:19, 22 September 2008

発現時間の調節をするために、以下の要件が挙げられる。

インデューサーの合成速度を下げる。
RBSの調整(B0030-->B0033)
コピー数の調整(5-->300)
レセプタータンパク質とAHLとの親和性を下げる-->複合体を形成しにくくする。
クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる(ref.3).
生物種ごとのクオラムセンシングについては、ref.9参照.

Construction(From BioBrick)

LuxI,LasI,CinI,RhlI(lacプロモーター)

LuxR,LasR,CinR,RhlR

Cross-Talk Check

RBS交換

既存のパーツ
- B0034+luxI
New parts(planning)
- B0033(weak)+luxI
- B0032(medium)+luxI
- B0031(weaker)+luxI

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 *[[Team:Chiba/jk/β/weak 4|week 4]]
 *[[Team:Chiba/jk/β/weak 5|week 5]]
+=='''実験について（どこにおいたらいいか分からなかったので～不必要かも）'''==
+===時間スイッチ作成===
+発現時間の調節をするために、以下の要件が挙げられる。
+#インデューサーの合成速度を下げる。<Br>RBSの調整(B0030-->B0033)<Br>コピー数の調整(5-->300)
+#レセプタータンパク質とAHLとの親和性を下げる-->複合体を形成しにくくする。<Br>クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる([[Team:Chiba/Reference/j|ref.3]]).<Br>生物種ごとのクオラムセンシングについては、[[Team:Chiba/Reference/j|ref.9]]参照.
+*ex)(  )内はシンターゼ
+**P.aeruginosa->C4-AHL(RhlI)
+**V. fisheri->C6-3-oxo-AHL(LuxI)
+**A.tumefaciens->C8-3-oxo-AHL(TraI)
+**P.aeruginosa->C10-3-oxo-AHL(VanI)
+**P.aeruginosa->C12-3-oxo-AHL(LasI)
+**R.leguminosarum->C14-3-hydroxy-AHL(CinI)
+'''Construction'''(From BioBrick)
+:*Sender(Autoinducer synthase)
+::LuxI,LasI,CinI,RhlI(lacプロモーター)
+:*Receiver
+::LuxR,LasR,CinR,RhlR
+'''Cross-Talk Check'''
+#LuxR vs LuxI('''OK'''),LasI('''OK'''),CinI(?),RhlI('''OK''')
+#LuxI vs LuxR,LasR,CinR,RhlR
+'''RBS交換'''<Br>
+*既存のパーツ
+**B0034+luxI<Br>
+*New parts(planning)
+**B0033(weak)+luxI
+**B0032(medium)+luxI
+**B0031(weaker)+luxI