Team:Chiba/jk/β
From 2008.igem.org
β班の実験ノート
Contents |
Week 1
- 17 August, 2008
- 18 August, 2008
- 19 August, 2008
- 20 August, 2008
- 21 August, 2008
- Transforation
- (Locate & 2 Punch ~iyama ver.~)
- 22 August, 2008
- 23 August, 2008
Week 2
- 24 August, 2008
- 25 August, 2008
- 26 August, 2008
- 27 August, 2008
- PCR
- Colony PCR of 5 colonies from ligation plates (27/8) and one from control plate(BBa_F2620(2007)).
- 30 August, 2008
Week 3
- 31 August, 2008
- 1 September, 2008
Week 4
reference
- L. Steindler.V.Venturi.:Detection of quorum sensing N-acyl homoserine lactone.FEMS Microbiol Lett 266 (2007) 1-9
- クオラムセンシングのクロストークについてのミニレビュー。クオラムセンシングを利用したAHLバイオセンサーについて、Table 1.にまとまっている。
- M.K Winson et al.Construction and analysis of luxCDABE-based plasmid sensors for investigating N-acyl homoserine lactone-mediated quorum sensing.FEMS Microbiology Letters 163 (1998) 185-192
- Figure 2.hは、LuxR、RhlR、LasRそれぞれの、C4-C14のN-acyl-L-homoserine lactone,C4-C14のN-(3-oxoacyl)-L-homoserine lactoneに対する感受性を比較したグラフ。
- Michiko E. Taga. Bonnie L. Bassler.:Chemical communication among bacteria.PNAS.November 25, 2003 �100 �suppl.2 �
- クオラムセンシングについての総説。アシル基の異なるAHL、およびそのシンターゼの紹介、AIPを用いたコミュニケーション、AiiA(AHL分解酵素)についてのまとめがある。
- K.M.GRAY et al.Interchangeability and Specificity of Components from the Quorum-Sensing Regulatory Systems of Vibrio fischeri and Pseudomonas aeruginosa.J.BACTERIOL.176,1994,3076-3080
- LasとLuxのクロストークについて調べた論文。Table 1とTable 2で、promotor、レセプタータンパク質、インデューサーそれぞれを交換して、レポーターの発現の様子を調べている。
- FK Balagadde et al.:A synthetic predator–prey ecosystem.Molecular Systems Biology 4:187,2008
- LuxとLasによるクオラムセンシングを利用した、プレデター・プレイモデル。LuxとLasのクロストークについて言及あり。
- Rong-guang Zhang et al.:Structure of a bacterial quorumsensing transcription factor complexed with pheromone and DNA.NATURE 417,2002,971-974
LuxR-familyタンパク質のTraR(Agrobacterium tumefaciens)の構造について、詳細な記述があります。
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