Team:Paris/Network analysis and design/Core system/mathematical analysis and simulations

From 2008.igem.org

(Difference between revisions)
Line 7: Line 7:
== Oscillation Analysis ==
== Oscillation Analysis ==
-
{{Paris/Toggle|Jacobian Analysis|Lipsum}}
+
{{Paris/Toggle|Jacobian Analysis|Team:Paris/Lipsum}}
== Parameters' changes ==
== Parameters' changes ==

Revision as of 17:31, 26 October 2008

Mathematical Analysis and Simulations



FIFO Analysis

understanding flia role

Oscillation Analysis

↓ Jacobian Analysis ↑


Lorem ipsum dolor sit amet, consectetuer adipiscing elit. Nam placerat suscipit ligula. Sed faucibus, ante nec porta accumsan, est neque consequat leo, eget ullamcorper diam erat at turpis. Donec dictum. Lorem ipsum dolor sit amet, consectetuer adipiscing elit. Sed a massa. Fusce consectetuer, ipsum eu aliquet pulvinar, sapien orci adipiscing orci, sit amet hendrerit dolor augue a nisi. Donec condimentum, est quis pellentesque euismod, ligula nisl malesuada nulla, ut venenatis libero tortor vitae tortor. Pellentesque a nibh vehicula mauris faucibus pellentesque. In dapibus congue neque. Nullam urna elit, ultricies id, lacinia eu, mollis sed, justo. Aliquam mollis. Nam pharetra nisl a lacus. Cras fringilla pharetra arcu. Sed interdum dolor vel dui. Praesent congue sollicitudin dui. Aliquam non mi. Pellentesque a arcu et augue pellentesque posuere. In hac habitasse platea dictumst. Nunc quis augue in elit mattis placerat.

Suspendisse id nulla eget mi accumsan iaculis. Ut eget velit sed arcu eleifend euismod. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Aenean venenatis. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Vivamus turpis nibh, interdum a, mattis ut, facilisis id, est. Integer eget velit. Nam enim. In aliquam justo sit amet pede. Morbi vehicula, orci sit amet iaculis lobortis, eros leo fringilla magna, quis tristique purus lacus id quam. Proin vel leo quis ligula consectetuer tempus. Ut ac metus. Sed facilisis, mauris eget egestas tempus, orci leo interdum magna, viverra porttitor mauris nunc vel magna. Pellentesque aliquet egestas lacus. Etiam nec eros bibendum neque tempor feugiat. Nam varius. Proin sed velit sed mi vehicula dapibus.

Nunc elit. Aliquam mauris enim, consequat quis, tincidunt eget, fringilla a, justo. Vivamus elementum. Mauris dapibus interdum massa. Etiam commodo sollicitudin nunc. Phasellus quis odio a nisl mollis blandit. Integer lobortis. Nulla imperdiet pharetra lectus. Nulla urna sem, faucibus vitae, congue sit amet, aliquet vel, mi. Sed vitae diam sit amet metus imperdiet gravida.

Ut at lacus. Proin nisi. Sed gravida dolor vitae lacus. Sed ac dui. Aliquam erat volutpat. Donec suscipit metus eget magna. Donec sodales, orci et volutpat consectetuer, lacus lectus posuere ante, at semper est velit a orci. Quisque ligula lacus, hendrerit in, tincidunt in, tincidunt id, magna. Nam odio ante, dapibus sed, hendrerit a, blandit non, odio. Aenean placerat. Aenean gravida sem sit amet velit. Phasellus felis. Phasellus ligula. Etiam sollicitudin mi ut diam.

Praesent ut ligula. Proin aliquet augue vel orci. Aliquam dictum. Sed mollis, nibh ac pulvinar fringilla, felis odio adipiscing purus, et congue leo ligula at tellus. Morbi nunc sapien, dignissim at, vestibulum nec, lobortis sit amet, mauris. Donec cursus rutrum felis. Donec purus ante, euismod sed, rutrum tincidunt, porttitor quis, magna. Ut ut neque vitae nisi laoreet malesuada. Integer non felis. Praesent convallis, est nec luctus faucibus, turpis mi eleifend ante, at blandit enim tellus id ipsum.

Parameters' changes

analysis of core system (biocham)

Description System Evaluation Observations
Core system
Core system mini.png
Orgsad.gif Non oscillating system
Removing the activation of envZ via FlhDC Core system delta flhDC envZ dotted mini.png Orgstar.gif Modest damped oscillations
Removing the auto-activation of flia Core system delta flia flia.png Orgstar.gifOrgstar.gif Damped oscillations
Removing both: the activation of envZ via FlhDC and the auto-activation of flia Core system delta flhDC envZ delta flia flia.png Orgstar.gifOrgstar.gif Damped oscillations with greater amplitud
Enhancing the inhibition of FlhDC via envZ; Removing both: the activation of envZ via FlhDC and the auto-activation of flia Core system envZ plus.png Orgstar.gifOrgstar.gifOrgstar.gif Conserved oscillations
Synchronized oscillations should be searched taking the last system as a starting point.