Team:Chiba/jk

From 2008.igem.org

(Difference between revisions)

Revision as of 10:37, 16 July 2008

Home / Internal / おしらせ / 実験ログ / 勉強会ログ / Meeting / BS / 考えてることを共有しようのページ / Graveyard

α-Team

シグナル分子システム作成班

冨永将大 Masahiro Tominaga
川崎浩平 Kohei Kawasaki
久保喬義 Takayoshi Kubo
杉山まい Mai Sugiyama

調べたこと

phnolの溶解度8.8mg[http://en.wikipedia.org/wiki/Phenol [1]]
tyrosineからphenolを合成する反応[http://www.kegg.jp/dbget-bin/www_bget?rn:R00728 [R00728]]
TPL(Tyrosine Phenol-Lyase)の原典

Kumagai, H.,and H. Hideki.Tyrosine Phenol Lyase Purification Crystallization,and Properties :Biol.Chem.,245,No.7,1767-1772,1970

TPL(Escherichia intermedia A-21由来)の特性について.以下の項目について説明があります。

stability
stoichiometry
sedimentation coefficient(20℃,water)= 7.77
diffusion coefficient(20℃,water)=4.42×10^-7cm²/sec
Michaelis constant = 2.31×10^-4 M　(基質はL-tyrosine)
inhibitor(L-alanine) K_i=6.53×10^-3 M
inhibitor(phenol) K_i=3.56×10^-5 M

Kumagai, H.,and H. Hideki.Tyrosine Phenol Lyase Coefector Requirements:Biol.Chem.,245,No.7,1773-1777,1970

TPLはピリドキサルリン酸(PLPA)がないと不活性である。また、最大活性を示すには、K⁺およびNH₄⁺が必要。Na⁺により不活性化。など、TPLの機構についての説明があります。

Nick J. P. Wierckx,* Hendrik Ballerstedt, Jan A. M. de Bont, and Jan Wery.Engineering of Solvent-Tolerant Pseudomonas putide S12 for Bioproduction of Phenol from Glucose:Appl. Environ. Microbiol.,71,No.12,8221-8227,2005

グルコースからチロシン経由でpseudomonas putide S１２で２５時間後にフェノールを１．５ｍＭ生成。オクタノールの媒質二相で100時間後にフェノールを５８ｍＭ生成

β-Team

出力システム作成班

福冨浩樹 Hiroki Fukutomi
小林あおい Aoi Kobayashi
香取崇広 Takahiro Katori
井山佳美 Yoshimi Iyama

Home / Internal / おしらせ / 実験ログ / 勉強会ログ / Meeting / BS / 考えてることを共有しようのページ / Graveyard

@@ Line 15: / Line 15: @@
 :*tyrosineからphenolを合成する反応[http://www.kegg.jp/dbget-bin/www_bget?rn:R00728 [R00728]]
 :*TPL(Tyrosine Phenol-Lyase)の原典
-::*Kumagai, H.,and H. Hideki.Tyrosine Phenol Lyase Purification Crystallization,and Properties '':Biol.Chem''.,'''245''',1767-1772,1970
+::*Kumagai, H.,and H. Hideki.Tyrosine Phenol Lyase Purification Crystallization,and Properties :''Biol.Chem''.,'''245''',No.7,1767-1772,1970
 :::TPL(''Escherichia intermedia'' A-21由来)の特性について.以下の項目について説明があります。
-:::#stability
+:::*stability
-:::#stoichiometry
+:::*stoichiometry
-:::#sedimentation coefficient(20℃,water)= 7.77
+:::*sedimentation coefficient(20℃,water)= 7.77
-:::#diffusion coefficient(20℃,water)=4.42×10<sup>-7</sup>cm<sup>2</sup>/sec
+:::*diffusion coefficient(20℃,water)=4.42×10<sup>-7</sup>cm<sup>2</sup>/sec
-:::#Michaelis constant = 2.31×10<sup>-4</sup> M　(基質はL-tyrosine)
+:::*Michaelis constant = 2.31×10<sup>-4</sup> M　(基質はL-tyrosine)
-:::#inhibitor(L-alanine)  K<sub>i</sub>=6.53×10<sup>-3</sup> M
+:::*inhibitor(L-alanine)  K<sub>i</sub>=6.53×10<sup>-3</sup> M
-:::#inhibitor(phenol)     K<sub>i</sub>=3.56×10<sup>-5</sup> M
+:::*inhibitor(phenol)     K<sub>i</sub>=3.56×10<sup>-5</sup> M
-::*Kumagai, H.,and H. Hideki.Tyrosine Phenol Lyase Coefector Requirements'':Biol.Chem''.,'''245''',1773-1777,1970
+::*Kumagai, H.,and H. Hideki.Tyrosine Phenol Lyase Coefector Requirements:''Biol.Chem''.,'''245''',No.7,1773-1777,1970
 :::TPLはピリドキサルリン酸(PLPA)がないと不活性である。また、最大活性を示すには、K<sup>+</sup>およびNH<sub>4</sub><sup>+</sup>が必要。Na<sup>+</sup>により不活性化。など、TPLの機構についての説明があります。
+:*Nick J. P. Wierckx,* Hendrik Ballerstedt, Jan A. M. de Bont, and Jan Wery.Engineering of Solvent-Tolerant Pseudomonas putide S12 for Bioproduction of Phenol from Glucose:''Appl. Environ. Microbiol.'','''71''',No.12,8221-8227,2005
+::グルコースからチロシン経由でpseudomonas putide S１２で２５時間後にフェノールを１．５ｍＭ生成。オクタノールの媒質二相で100時間後にフェノールを５８ｍＭ生成
 ----