Team:Chiba/Project/j

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イントロ

クオラムセンシングを利用して、入力がぞんざいした時間を測る。すなわち、タイマーを作成する。クオラムセンシングを利用することにより、シグナル分子の蓄積を時間に換算することができ、かつ、それを読み出すことができる。私たちは、クオラムセンシングの時間スケールを変更することによって、いくつかのタイマーを作成することを目標とする。

時間スイッチ

クオラムセンシングによる細胞間コミュニケーションを利用する。 -->*なぜクオラムセンシングを使うのか
蓄積したもの(->時間に換算する)を読み出して、出力に結び付けることができるから。

Y.pseudotuberculosisとP. aeruginosaでは、AHLsは、対数増殖期には蓄積するが、ステイショナリーフェイズでは大部分が消失してしまうという報告あり（培養液中）(ref.8)。

発現時間の調節をするために、以下の要件が挙げられる。

インデューサーの合成速度を下げる。
RBSの調整(B0030->B0033),コピー数の調整(5->300)
レセプタータンパク質の感度を下げる。
クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる(ref.3)。

ex)( )内はシンターゼ
- P.aeruginosa->C4-AHL(RhlI)
- V. fisheri->C6-3-oxo-AHL(LuxI)
- A.tumefaciens->C8-3-oxo-AHL(TraI)
- P.aeruginosa->C10-3-oxo-AHL(VanI)
- P.aeruginosa->C12-3-oxo-AHL(LasI)
- R.leguminosarum->C14-3-hydroxy-AHL(CinI)

Construction(From BioBrick)

Sender(Autoinducer synthase)

LuxI,LasI,CinI,RhlI(lacプロモータ)

Receiver

LuxR,LasR,CinR,RhlR

Cross-Talk Check

LuxR vs LuxI(OK),LasI(OK),CinI,RhlI(OK)
LuxI vs LuxR,LasR,CinR,RhlR

RBS交換

既存のパーツ
- Boo34+luxI
New parts(planning)
- Boo33(weak)+luxI
- Boo32(medium)+luxI
- Boo31(weaker)+luxI

More about Quorum Sensing

[http://parts.mit.edu/registry/index.php/Featured_Parts:Cell-Cell-Signaling Cell-Cell-Signaling]
[http://www.che.caltech.edu/groups/fha/quorum.html About Quorum sensing]

入力

出力

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@@ Line 9: / Line 9: @@
 == '''イントロ''' ==
+クオラムセンシングを利用して、入力がぞんざいした'''時間'''を測る。すなわち、タイマーを作成する。
+クオラムセンシングを利用することにより、シグナル分子の蓄積を時間に換算することができ、かつ、それを読み出すことができる。
+私たちは、クオラムセンシングの時間スケールを変更することによって、いくつかのタイマーを作成することを目標とする。
 =='''時間スイッチ'''==
 '''クオラムセンシング'''による細胞間コミュニケーションを利用する。

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イントロ

時間スイッチ

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