Team:Chiba/Project/j

From 2008.igem.org

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(時間スイッチ)
(デザイン)
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発現時間の調節をするために、以下の要件が挙げられる。
+
発現時間を調節する(Time-Delayをつくる)ために以下を利用する。
#インデューサーの合成速度を下げる。<Br>RBSの調整(B0030-->B0033),コピー数の調整(5-->300)
#インデューサーの合成速度を下げる。<Br>RBSの調整(B0030-->B0033),コピー数の調整(5-->300)
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#レセプタータンパク質の感度を下げる。<Br>クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる([[Team:Chiba/Reference/j|ref.3]]).生物ごとのクオラムセンシングについては、[[Team:Chiba/Reference/j|ref.9]]参照.
+
#レセプタータンパク質の感度を下げる。<Br>クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる([[Team:Chiba/Reference/j|ref.3]]).<Br>生物ごとのクオラムセンシングについては、[[Team:Chiba/Reference/j|ref.9]]参照.
*ex)(  )内はシンターゼ
*ex)(  )内はシンターゼ
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:*Receiver
:*Receiver
::LuxR,LasR,CinR,RhlR
::LuxR,LasR,CinR,RhlR
-
 
-
'''Cross-Talk Check'''
 
-
#LuxR vs LuxI('''OK'''),LasI('''OK'''),CinI(?),RhlI('''OK''')
 
-
#LuxI vs LuxR,LasR,CinR,RhlR
 
-
 
-
'''RBS交換'''<Br>
 
-
*既存のパーツ
 
-
**B0034+luxI<Br>
 
-
*New parts(planning)
 
-
**B0033(weak)+luxI
 
-
**B0032(medium)+luxI
 
-
**B0031(weaker)+luxI
 
'''More about Quorum Sensing'''<Br>
'''More about Quorum Sensing'''<Br>

Revision as of 07:55, 14 September 2008

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Contents

ゴール

クオラムセンシングを利用して、入力がぞんざいした時間を測る。すなわち、タイマーを作成する。 クオラムセンシングを利用することにより、シグナル分子の蓄積を時間に換算することができ、かつ、それを読み出すことができる。 私たちは、クオラムセンシングの時間スケールを変更することによって、いくつかのタイマーを作成することを目標とする。

デザイン

クオラムセンシングによる細胞間コミュニケーションを利用する。

  • 蓄積したもの(->時間に換算する)を読み出して、出力に結び付けることができる。


発現時間を調節する(Time-Delayをつくる)ために以下を利用する。

  1. インデューサーの合成速度を下げる。
    RBSの調整(B0030-->B0033),コピー数の調整(5-->300)
  2. レセプタータンパク質の感度を下げる。
    クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる(ref.3).
    生物ごとのクオラムセンシングについては、ref.9参照.
  • ex)( )内はシンターゼ
    • P.aeruginosa->C4-AHL(RhlI)
    • V. fisheri->C6-3-oxo-AHL(LuxI)
    • A.tumefaciens->C8-3-oxo-AHL(TraI)
    • P.aeruginosa->C10-3-oxo-AHL(VanI)
    • P.aeruginosa->C12-3-oxo-AHL(LasI)
    • R.leguminosarum->C14-3-hydroxy-AHL(CinI)

Construction(From BioBrick)

  • Sender(Autoinducer synthase)
LuxI,LasI,CinI,RhlI(lacプロモーター)
  • Receiver
LuxR,LasR,CinR,RhlR

More about Quorum Sensing

  • [http://parts.mit.edu/registry/index.php/Featured_Parts:Cell-Cell-Signaling Cell-Cell-Signaling]
  • [http://www.che.caltech.edu/groups/fha/quorum.html About Quorum sensing]

入力

出力

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