Team:Chiba/Project/j

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Revision as of 12:36, 16 September 2008

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ゴール

クオラムセンシングによる細胞間コミュニケーションを利用して、入力が存在した時間を測る。すなわち、タイマーを作成する。クオラムセンシングを利用することにより、シグナル分子の蓄積を時間に換算することができ、かつ、それを読み出すことができる。クオラムセンシングの時間スケールを変更することによって、いくつかのタイマーを作成することを目標とする。

プロジェクトデザイン

クオラムセンシング

特定の入力に曝されたバクテリアは、シグナル分子（AHL:N-Acyl-L-homoserine Lactone）を合成する。シグナル分子が閾値を超えると、レポータータンパク質が発現。入力にさらされていた時間を知らせる、タイマーとなる。

クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる(ref.3).
生物ごとのクオラムセンシングについては、ref.9参照.

Strain	Signal Molecule	Enzyme
P.aeruginosa	C4-HSL	RhlI
V. fisheri	C6-3-oxo-HSL	LuxI
A.tumefaciens	C8-3-oxo-HSL	TraI
P.aeruginosa	C10-3-oxo-HSL	VanI
P.aeruginosa	C12-3-oxo-HSL	LasI
R.leguminosarum	C14-3-hydroxy-HSL	CinI

Construction(From BioBrick)

Sender(Autoinducer synthase)

LuxI,LasI,CinI,RhlI(lacプロモーター)

Receiver

LuxR,LasR,CinR,RhlR

More about Quorum Sensing

[http://parts.mit.edu/registry/index.php/Featured_Parts:Cell-Cell-Signaling Cell-Cell-Signaling]
[http://www.che.caltech.edu/groups/fha/quorum.html About Quorum sensing]

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@@ Line 18: / Line 18: @@
-発現時間を調節する(Time-Delayをつくる)ために以下を利用する。
-#インデューサーの合成速度を下げる。<Br>RBSの調整(B0030-->B0033),コピー数の調整(5-->300)
+クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる([[Team:Chiba/Reference/j|ref.3]]).<Br>生物ごとのクオラムセンシングについては、[[Team:Chiba/Reference/j|ref.9]]参照.
-#レセプタータンパク質の感度を下げる。<Br>クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる([[Team:Chiba/Reference/j|ref.3]]).<Br>生物ごとのクオラムセンシングについては、[[Team:Chiba/Reference/j|ref.9]]参照.