Team:Chiba/Reporter

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(→Experiment)
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==Experiment==
==Experiment==
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大腸菌:XL10G
*Luciferase
*Luciferase
:*[http://partsregistry.org/Part:BBa_J52008 BBa_J52008]+[http://partsregistry.org/Part:BBa_F2620 BBa_F2620]
:*[http://partsregistry.org/Part:BBa_J52008 BBa_J52008]+[http://partsregistry.org/Part:BBa_F2620 BBa_F2620]
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*β-gal (X-gal assay)
*β-gal (X-gal assay)
:*PUC19(plac-LacZ)
:*PUC19(plac-LacZ)
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*装置 Equipment
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:shaking incubator(37°C,30°C)
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::Innova 4200 Benchtop or Floor-Stackable Incubator Shaker(37°C) 
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:46-well plate(deep well)
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:96-well plate(deep well)
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:Fluoroskan Ascent 2.5(program:Ascent Software Version 2.6)
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:Beckman Allegratm X-12R Centrifuga(Beckman Coulter)
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*固体編
*固体編
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プレ培<br>
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固体培地(pLacであれば0.2%グルコース入り)にまく<br>  
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固体培地(pLacであれば0.2%グルコース入り)に大腸菌（XL10G)まく<br>  
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コロニーを新しい固体培地(pLacであればIPTG, ptetであればAHL,　LacZならばIPTGとX-gal）にコロニーリフトする＝スタート<br>
コロニーを新しい固体培地(pLacであればIPTG, ptetであればAHL,　LacZならばIPTGとX-gal）にコロニーリフトする＝スタート<br>
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37&deg；Cのしんとう培養器で培養<br>
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37&deg;Cのしんとう培養器で培養<br>
30分ごとに目視で確認できるか観察<br>
30分ごとに目視で確認できるか観察<br>
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プレ培<br>
プレ培<br>
コロニーを固体培地からピックし、LB培養液2ml（pLacであれば0.2%グルコース入り）で12時間培養(37&deg;C)<br>
コロニーを固体培地からピックし、LB培養液2ml（pLacであれば0.2%グルコース入り）で12時間培養(37&deg;C)<br>
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本培<br>
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OD値を計測して、菌数を合わせるため培養液を1/200に希釈する。<br>
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OD=1.00くらいになるまで37&deg;Cで培養<br>
==Result==
==Result==

Revision as of 12:50, 29 October 2008

Chiba-U.gif

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Reporter

レスポンスの早いレポーターを選ぶことが目的


  • Luciferase
  • 蛍光たんぱく
  • β-gal (X-gal assay)

Experiment

大腸菌:XL10G

  • Luciferase
  • [http://partsregistry.org/Part:BBa_J52008 BBa_J52008]+[http://partsregistry.org/Part:BBa_F2620 BBa_F2620]
  • [http://partsregistry.org/Part:BBa_J32007 BBa_J32007]
  • 蛍光たんぱく
  • GFP
  • pGFPuv
  • YFP
  • [http://partsregistry.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K084003 BBa_K084003]
  • mCherry
  • ptet-mCherry
  • β-gal (X-gal assay)
  • PUC19(plac-LacZ)
  • 装置 Equipment
shaking incubator(37°C,30°C)
Innova 4200 Benchtop or Floor-Stackable Incubator Shaker(37°C)
46-well plate(deep well)
96-well plate(deep well)
Fluoroskan Ascent 2.5(program:Ascent Software Version 2.6)
Beckman Allegratm X-12R Centrifuga(Beckman Coulter)


  • 固体編

固体培地(pLacであれば0.2%グルコース入り)にまく
コロニーを新しい固体培地(pLacであればIPTG, ptetであればAHL,　LacZならばIPTGとX-gal）にコロニーリフトする＝スタート
37°Cのしんとう培養器で培養
30分ごとに目視で確認できるか観察

  • 液体編

プレ培
コロニーを固体培地からピックし、LB培養液2ml（pLacであれば0.2%グルコース入り）で12時間培養(37°C)
本培
OD値を計測して、菌数を合わせるため培養液を1/200に希釈する。
OD=1.00くらいになるまで37°Cで培養

Result

Conclusion

このプロジェクトでは、発現するまでの時間を変えることが目的である

分解されやすいLuciferineやX-galを基質とするLuciferaseやβ-galでは、時間がたつごとに基質濃度が下がり、出力までの時間が長くなってしまう

そのため、基質のいらない蛍光タンパク質が適している。

基質も合成するLuxCDABEを発現させると、レスポンスが早くなる可能性がある。

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