Team:Chiba/Project/j

From 2008.igem.org

(Difference between revisions)

Revision as of 07:58, 14 September 2008

ホーム	メンバー紹介	プロジェクト紹介	Parts Submitted to the Registry	モデリング	ノート

プロジェクトデザイン

クオラムセンシングによる細胞間コミュニケーションを利用して、入力が存在した時間を測る。すなわち、タイマーを作成する。クオラムセンシングを利用することにより、シグナル分子の蓄積を時間に換算することができ、かつ、それを読み出すことができる。クオラムセンシングの時間スケールを変更することによって、いくつかのタイマーを作成することを目標とする。

発現時間を調節する(Time-Delayをつくる)ために以下を利用する。

インデューサーの合成速度を下げる。
RBSの調整(B0030-->B0033),コピー数の調整(5-->300)
レセプタータンパク質の感度を下げる。
クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる(ref.3).
生物ごとのクオラムセンシングについては、ref.9参照.

ex)( )内はシンターゼ
- P.aeruginosa-->C4-AHL(RhlI)
- V. fisheri-->C6-3-oxo-AHL(LuxI)
- A.tumefaciens-->C8-3-oxo-AHL(TraI)
- P.aeruginosa-->C10-3-oxo-AHL(VanI)
- P.aeruginosa-->C12-3-oxo-AHL(LasI)
- R.leguminosarum-->C14-3-hydroxy-AHL(CinI)

Construction(From BioBrick)

Sender(Autoinducer synthase)

LuxI,LasI,CinI,RhlI(lacプロモーター)

Receiver

LuxR,LasR,CinR,RhlR

More about Quorum Sensing

[http://parts.mit.edu/registry/index.php/Featured_Parts:Cell-Cell-Signaling Cell-Cell-Signaling]
[http://www.che.caltech.edu/groups/fha/quorum.html About Quorum sensing]

入力

出力

ホーム	メンバー紹介	プロジェクト紹介	Parts Submitted to the Registry	モデリング	ノート

@@ Line 20: / Line 20: @@
 *ex)(  )内はシンターゼ
-**P.aeruginosa->C4-AHL(RhlI)
+**P.aeruginosa-->C4-AHL(RhlI)
-**V. fisheri->C6-3-oxo-AHL(LuxI)
+**V. fisheri-->C6-3-oxo-AHL(LuxI)
-**A.tumefaciens->C8-3-oxo-AHL(TraI)
+**A.tumefaciens-->C8-3-oxo-AHL(TraI)
-**P.aeruginosa->C10-3-oxo-AHL(VanI)
+**P.aeruginosa-->C10-3-oxo-AHL(VanI)
-**P.aeruginosa->C12-3-oxo-AHL(LasI)
+**P.aeruginosa-->C12-3-oxo-AHL(LasI)
-**R.leguminosarum->C14-3-hydroxy-AHL(CinI)
+**R.leguminosarum-->C14-3-hydroxy-AHL(CinI)
 '''Construction'''(From BioBrick)