Team:Chiba/Experiments:copy number
From 2008.igem.org
(Difference between revisions)
(→Experiment) |
|||
Line 21: | Line 21: | ||
<br clear=all> | <br clear=all> | ||
===Experiment=== | ===Experiment=== | ||
- | + | oriがcolE1のハイコピーベクターにのったBBa_T9002と、oriがP15Aのローコピーベクターに乗ったT9002バリエーションを使用した。 | |
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
+ | これらを比較することでコピーナンバーを変えることでの影響を調べた。 | ||
+ | 以下の遺伝子回路を使って、実験を行った。 | ||
+ | ===='''Sender'''==== | ||
+ | *AHL autoinucer[http://partsregistry.org/Part:BBa_S03623 (BBa_S03623) ] | ||
+ | [[Image:LuxI-sender Chiba.gif|left|]]<br clear=all> | ||
+ | ===='''Receiver'''==== | ||
+ | *[http://partsregistry.org/Part:BBa_T9002 BBa_T9002 (Express GFP in response to AHL)] | ||
+ | [[Image:High-Copy-Receiver Chiba.gif]]<br clear=all> | ||
+ | *Low Copy Receiver | ||
+ | [[Image:Low-Copy-Receiver Chiba.gif]] | ||
+ | これらのほかにBBa_T9002にはChloramphenicol耐性マーカーを持つ空ベクター、Low copyバリエーションにはAmpicillin耐性マーカーの空ベクターをダブルトランスフォーメーションさせた。 | ||
===Result & Discussion=== | ===Result & Discussion=== |
Revision as of 20:09, 29 October 2008
Home | The Team | The Project | Parts Submitted to the Registry | Reference | Notebook | Acknowledgements |
---|
Copy number of Receiver Plasmid
Design
レシーバーのコピーナンバーを変えることで、応答までの時間を変える
コピーナンバーを変えれば、レシーバーによるLuxRの合成量は変化する
AHLを受け取るLuxRが変わるので応答閾値までの時間が変わると考えた
Experiment
oriがcolE1のハイコピーベクターにのったBBa_T9002と、oriがP15Aのローコピーベクターに乗ったT9002バリエーションを使用した。
これらを比較することでコピーナンバーを変えることでの影響を調べた。
以下の遺伝子回路を使って、実験を行った。
Sender
- AHL autoinucer[http://partsregistry.org/Part:BBa_S03623 (BBa_S03623) ]
Receiver
- [http://partsregistry.org/Part:BBa_T9002 BBa_T9002 (Express GFP in response to AHL)]
- Low Copy Receiver
これらのほかにBBa_T9002にはChloramphenicol耐性マーカーを持つ空ベクター、Low copyバリエーションにはAmpicillin耐性マーカーの空ベクターをダブルトランスフォーメーションさせた。
Result & Discussion
more about Plasmid Copy number
- クオラムセンシングに関わる遺伝子のベクタープラスミドのコピーナンバーを少なくすることで、遺伝子発現が遅くなる
- それと同時に、遺伝子発現の最大値自体も少なくなってしまう
more about experimental result
Method
- Transformed sender(Ptet-LuxI), high copy receiver(Ptet-LuxR-Plux-GFP-colE1) and Medium copy receiver(Ptet-LuxR-Plux-GFP-p15A) respectively into E coli strains(BD⊿FliC).
- Inoculated them independently in liquid media. Incubated at 37°C 12h.
- Inoculated again in Fresh liquid media upto about OD600=2 at 37°C
- Washed sender and receivers.
- Mixed them. (Sender:Receiver=1000μL:1000μL)
- Incubated at 30°C.
- Measured intensity of green fluorescence at regular time intervals.(Fluoroskan AscentR FL&Fluoroskan AscentR Thermo ELECTRON CORPORATION)