Experiment

From 2008.igem.org

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-
<table width="971" height="3781" border="0" align="center" cellpadding="0" cellspacing="0" bgcolor="#14285F">
+
<tr bgcolor="02021e"><td height="140" colspan="2" nowrap="nowrap" bgcolor="#03438A"><!--DWLayoutEmptyCell-->&nbsp;</td>
-
  <!--DWLayoutTable-->
+
</tr><tr><td height="2" colspan="4" bgcolor="#14285F"><!--DWLayoutEmptyCell-->&nbsp;</td>
-
  <tr bgcolor="02021e">
+
-
    <td height="140" colspan="2" nowrap="nowrap" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/igem.org/2/28/Logonew2.jpg" width="465" height="130" /></td>
+
-
    <td colspan="2" valign="bottom" nowrap="nowrap" bgcolor="#03438A" id="logo"><p><span class="STYLE23"><a href="javascript:;" class="STYLE15"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/f/fc/Logonew1.jpg" width="342" height="130" /></a><a href="https://2008.igem.org/Team:Tianjin" class="STYLE15"> <span class="STYLE21">aaaaaa</span>Home</a></span></p></td>
+
-
  </tr>
+
-
 
+
-
  <tr>
+
-
    <td height="2" colspan="4" bgcolor="#14285F"><img src="mm_spacer.gif" alt="" width="1" height="2" border="0" /></td>
+
   </tr>
   </tr>
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   <tr>
   <tr>
   <td width="6" height="3600">&nbsp;</td>
   <td width="6" height="3600">&nbsp;</td>
-
   <td colspan="2" valign="top" bgcolor="#03438A"><table border="0" cellspacing="0" cellpadding="2" width="963">
+
   <td colspan="2" valign="top" bgcolor="#03438A"><table width="933" border="0" align="center" cellpadding="2" cellspacing="0">
     <!--DWLayoutTable-->
     <!--DWLayoutTable-->
     <tr>
     <tr>
-
       <td width="3" height="17"></td>
+
       <td height="17" colspan="2"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/igem.org/2/28/Logonew2.jpg" width="465" height="133" /><span class="STYLE28"><span class="STYLE23"><a href="javascript:;" class="STYLE15"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/f/fc/Logonew1.jpg" width="342" height="130" />Home</a></span></span></td>
-
          <td width="944"></td>
+
    </tr>
-
          <td width="4"></td>
+
-
      </tr>
+
     <tr>
     <tr>
-
       <td height="59" colspan="3" valign="bottom" bgcolor="#03438A"><span class="STYLE28"> <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/d/dc/11.JPG" width="61" height="43"> Experiment results </span></td>
+
       <td height="59" colspan="2" valign="bottom" bgcolor="#03438A"><span class="STYLE28"> <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/d/dc/11.JPG" width="66" height="55"> Experiment results </span></td>
-
        </tr>
+
     </tr>
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+
-
       
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-
       
+
-
        <tr>
+
-
          <td height="25">&nbsp;</td>
+
-
          <td>&nbsp;</td>
+
-
          <td>&nbsp;</td>
+
-
        </tr>
+
     <tr>
     <tr>
-
       <td height="3432">&nbsp;</td>
+
       <td width="625" height="25"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/8/85/What%EF%BC%9F.jpg" width="625" height="566"></td>
-
          <td valign="top" bgcolor="#FFFFFF"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
      <td width="300"><p class="STYLE30"><span class="STYLE34">Increase of the initial population density enhances system resistance to antibiotics.</span><br>
-
              <!--DWLayoutTable-->
+
        In our basic  design, the EG cells can express ampicillin resistant protein constantly and  kanamycin resistant protein by sensing the AHL which is given by the ER cells. And meanwhile the ER cell can express kanamycin resistant protein constantly  and ampicillin resistant protein by sensing the BHL which is given by the EG cells.</p></td>
-
              <tr>
+
    </tr>
-
                <td width="1" height="4"></td>
+
-
                <td width="949"></td>
+
-
              </tr>
+
-
              <tr>
+
-
                <td height="533"></td>
+
-
                <td valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
-
                    <!--DWLayoutTable-->
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="53" colspan="3" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><p><span class="STYLE32">Synthetic convertible  ecosystem</span><BR>
+
-
                      </p></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td width="472" height="5"></td>
+
-
                      <td width="4"></td>
+
-
                      <td width="473"></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                   
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="54" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><div class="STYLE38">EG cells received 3OC6HSL signal molecular and expressed ampicillin resistance protein</div></td>
+
-
                      <td>&nbsp;</td>
+
-
                      <td align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><div class="STYLE39">ER cells received C4HSL signal molecular and expressed kanamycin resistance protein</div></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                   
+
-
                   
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-
                   
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                    <tr>
+
-
                      <td height="6"></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
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                    </tr>
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-
                   
+
-
                   
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-
                   
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="366" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/thumb/5/57/113.JPG/772px-113.JPG" width="459" height="354"></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/thumb/c/c9/112.JPG/772px-112.JPG" width="459" height="355"></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="42" align="center" valign="top" bgcolor="#03438A"><div class="STYLE36">The growth curve and the expression of the GFP of the EG cells in different condition</div></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td align="center" valign="top" bgcolor="#03438A"><div class="STYLE36">The growth curve and the expression of the GFP of the ER cells in different condition</div></td>
+
-
                    </tr>
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-
                   
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                    <tr>
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-
                      <td height="7"></td>
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-
                      <td></td>
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-
                      <td></td>
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-
                   
+
-
                   
+
-
                </table></td>
+
-
              </tr>
+
-
             
+
-
              <tr>
+
-
                <td height="555"></td>
+
-
                <td valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
-
                    <!--DWLayoutTable-->
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="51" colspan="3" valign="middle" bgcolor="#03438A"><div class="STYLE39">ER overwhelms EG in population at the existence of antibiotics </div></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td width="472" height="4"></td>
+
-
                      <td width="5"></td>
+
-
                      <td width="472"></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="492" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/4/4a/117.JPG" width="392" height="474"></td>
+
-
                      <td>&nbsp;</td>
+
-
                      <td align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/thumb/d/d5/115.jpg/635px-115.jpg" width="458" height="431"></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="8"></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                    </tr>
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-
                   
+
-
                   
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-
                   
+
-
                   
+
-
                </table></td>
+
-
              </tr>
+
-
              <tr>
+
-
                <td height="481"></td>
+
-
                <td valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
-
                    <!--DWLayoutTable-->
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="46" colspan="2" valign="middle" bgcolor="#03438A"><div><span class="STYLE39"><strong>Antibiotic changes detected by </strong>LC-MS/MS</span></div></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td width="520" height="5"></td>
+
-
                      <td width="429"></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                   
+
-
                   
+
-
                   
+
-
                   
+
-
                   
+
-
                   
+
-
                   
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="422" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/7/7c/110.jpg" width="514" height="415"></td>
+
-
                      <td valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" bgcolor="#03438A">
+
-
                          <!--DWLayoutTable-->
+
-
                          <tr>
+
-
                            <td width="11" height="421">&nbsp;</td>
+
-
                            <td width="418" valign="middle" bgcolor="#03438A"><div class="STYLE36"><span class="STYLE40">B</span>oth ampicillin and kanamycin decrease with the increase of population density due to gradual decomposition of antibiotics. Most of antibiotics were decomposed at the lag phase and decreased very quickly to a low level at the beginning of the exponential phase. </div></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                          <tr>
+
-
                            <td height="1"></td>
+
-
                            <td></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                         
+
-
                         
+
-
                      </table></td>
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                    </tr>
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                      <td height="8"></td>
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                      <td></td>
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                    </tr>
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                </table></td>
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              </tr>
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              <tr>
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                <td height="352"></td>
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                <td valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
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-
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+
-
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+
-
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-
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+
-
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+
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                      </table></td>
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                      <td>&nbsp;</td>
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                      <td valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
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-
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-
                            <td width="312" height="254" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/7/76/120.jpg" width="298" height="239"></td>
+
-
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+
-
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+
-
                            <td height="44" valign="top" bgcolor="#03438A"><div>
+
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+
-
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+
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+
-
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                            <td height="1"></td>
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                          </tr>
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+
-
                         
+
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                      </table></td>
+
-
                      <td>&nbsp;</td>
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-
                      <td valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
-
                          <!--DWLayoutTable-->
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-
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                            <td width="313" height="254" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src=" https://static.igem.org/mediawiki/2008/8/8f/130.JPG" width="297" height="238"></td>
+
-
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+
-
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+
-
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+
-
                              <div class="STYLE36">EG= 1×107/ml&#13;</div>
+
-
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+
-
                                <div></div>
+
-
                            </div></td>
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                          </tr>
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                      </table></td>
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                    </tr>
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                    <tr>
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-
                      <td height="6"></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
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                      <td></td>
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                      <td></td>
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-
                 
+
-
                 
+
-
                </table></td>
+
-
              </tr>
+
-
              <tr>
+
-
                <td height="760"></td>
+
-
                <td valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
-
                    <!--DWLayoutTable-->
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="41" colspan="7" valign="top" bgcolor="#03438A"><p>&nbsp;</p>                      </td>
+
-
                    </tr>
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td width="309" height="5"></td>
+
-
                      <td width="7"></td>
+
-
                      <td width="203"></td>
+
-
                      <td width="6"></td>
+
-
                      <td width="97"></td>
+
-
                      <td width="4"></td>
+
-
                      <td width="323"></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                   
+
-
                   
+
-
                   
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-
                   
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-
                   
+
-
                   
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="281" valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
-
                        <!--DWLayoutTable-->
+
-
                        <tr>
+
-
                          <td width="312" height="236" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/0/03/21.jpg" width="296" height="224"></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                        <tr>
+
-
                          <td height="45" valign="top" bgcolor="#03438A"><div>
+
-
                            <div class="STYLE36">AMP=4mg/ml&#13;</div>
+
-
                                <div class="STYLE36">KAN=1mg/ml</div>
+
-
                            </div></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                       
+
-
                       
+
-
                       
+
-
                      </table></td>
+
-
                      <td>&nbsp;</td>
+
-
                      <td colspan="3" valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
-
                          <!--DWLayoutTable-->
+
-
                          <tr>
+
-
                            <td width="310" height="236" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/1/13/22.jpg" width="297" height="224"></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                          <tr>
+
-
                            <td height="45" valign="top" bgcolor="#03438A"><div>
+
-
                              <div class="STYLE36">AMP=8mg/ml&#13;</div>
+
-
                                <div class="STYLE36">KAN=1mg/ml</div>
+
-
                            </div></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                         
+
-
                         
+
-
                      </table></td>
+
-
                      <td>&nbsp;</td>
+
-
                      <td valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
-
                          <!--DWLayoutTable-->
+
-
                          <tr>
+
-
                            <td width="313" height="235" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src=" https://static.igem.org/mediawiki/2008/6/64/23.jpg" width="300" height="223"></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                          <tr>
+
-
                            <td height="45" valign="top" bgcolor="#03438A"><div>
+
-
                              <div class="STYLE36">AMP=8mg/ml&#13;</div>
+
-
                                <div class="STYLE36">KAN=1.6mg/ml</div>
+
-
                            </div></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                          <tr>
+
-
                            <td height="1"></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                         
+
-
                      </table></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="5"></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="422" colspan="3" valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
-
                        <!--DWLayoutTable-->
+
-
                        <tr>
+
-
                          <td width="519" height="397" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/a/ad/24.jpg" width="460" height="384"></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                        <tr>
+
-
                          <td height="25" align="center" valign="top" bgcolor="#03438A"><span class="STYLE36">simulation</span></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                       
+
-
                       
+
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+
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+
-
                       
+
-
                       
+
-
                      </table></td>
+
-
                      <td>&nbsp;</td>
+
-
                      <td colspan="3" valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" bgcolor="#03438A">
+
-
                          <!--DWLayoutTable-->
+
-
                          <tr>
+
-
                            <td width="421" height="422" valign="top" bgcolor="#03438A"><!--DWLayoutEmptyCell-->&nbsp;</td>
+
-
                          </tr>
+
-
                      </table></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                   
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="6"></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                    </tr>
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+
-
                 
+
-
                 
+
-
                </table></td>
+
-
              </tr>
+
-
              <tr>
+
-
                <td height="735"></td>
+
-
                <td valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
-
                    <!--DWLayoutTable-->
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td height="41" colspan="7" valign="middle" bgcolor="#03438A"><div class="STYLE42">Influence of antibiotics on population dynamics</div></td>
+
-
                    </tr>
+
-
                    <tr>
+
-
                      <td width="312" height="6"></td>
+
-
                      <td width="6"></td>
+
-
                      <td width="201"></td>
+
-
                      <td width="8"></td>
+
-
                      <td width="102"></td>
+
-
                      <td width="7"></td>
+
-
                      <td width="313"></td>
+
-
                    </tr>
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-
                    <tr>
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-
                      <td height="293" valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
-
                        <!--DWLayoutTable-->
+
-
                        <tr>
+
-
                          <td width="312" height="250" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/f/fe/31.JPG" width="301" height="236"></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                        <tr>
+
-
                          <td height="43" valign="top" bgcolor="#03438A"><div class="STYLE36">EG= 1×107/ml</div></td>
+
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                          </tr>
+
-
                       
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                      </table></td>
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-
                      <td>&nbsp;</td>
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                      <td colspan="3" valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
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                          <!--DWLayoutTable-->
+
-
                          <tr>
+
-
                            <td width="311" height="250" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/8/85/32.jpg" width="302" height="236"></td>
+
-
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+
-
                          <tr>
+
-
                            <td height="43" valign="top" bgcolor="#03438A"><div class="STYLE36">ER= 1×106/ml</div></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                         
+
-
                      </table></td>
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-
                      <td>&nbsp;</td>
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                      <td valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
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                          <!--DWLayoutTable-->
+
-
                          <tr>
+
-
                            <td width="313" height="250" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/d/da/33.jpg" width="304" height="236"></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                          <tr>
+
-
                            <td height="43" valign="top" bgcolor="#03438A"><div>
+
-
                              <div>
+
-
                                <div class="STYLE36">EG= 5×106/ml&#13;</div>
+
-
                                  <div class="STYLE36">ER= 1×106/ml</div>
+
-
                                </div>
+
-
                            </div>                          </td>
+
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                          </tr>
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-
                         
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                      </table>                    </td>
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-
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-
                      <td height="5"></td>
+
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                      <td></td>
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                      <td></td>
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-
                      <td></td>
+
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                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
+
-
                      <td></td>
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                    <tr>
+
-
                      <td height="382" colspan="3" valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
+
-
                        <!--DWLayoutTable-->
+
-
                        <tr>
+
-
                          <td width="519" height="349" align="center" valign="middle" bgcolor="#03438A"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/f/fe/34.jpg" width="457" height="337"></td>
+
-
                          </tr>
+
-
                        <tr>
+
-
                          <td height="33" align="center" valign="top" bgcolor="#03438A"><span class="STYLE36">simulation</span></td>
+
-
                          </tr>
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-
                       
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                      <td>&nbsp;</td>
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                      <td colspan="3" valign="top"><table width="100%" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" bgcolor="#03438A">
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                          <!--DWLayoutTable-->
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       <td height="63">&nbsp;</td>
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       <td height="17" rowspan="2"><p><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/7/7c/Aaaa.jpg" width="625" height="605"></p>        </td>
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          <td>&nbsp;</td>
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      <td height="11"><p class="STYLE30">By changing the  inoculation concentration higher, the two different kinds of cells can help  each other grew better. As shown in the graphs the final population of both of  the two kinds of cells became higher and higher in the high antibiotics environment.</p>
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      <td height="104"><p class="STYLE30">The initial  concentration of ampicillin and kanamycin in the culture determined the least inoculating  population of the EG and ER cells.</p></td>
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      <td height="6"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2008/e/ef/Why.jpg" width="625" height="682"></td>
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      <td height="6"><p class="STYLE35">We did some comparisons  under different condition to show the effect of mutualism. <br>
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        The result shows  that with the help of each other both of them can survive in some region either  of them can not live alone. </p></td>
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      <td height="70" colspan="3"><div align="right" class="STYLE36"><a href="https://2008.igem.org/Project">back to <strong>Project</strong></a> </div></td>
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Revision as of 12:07, 29 October 2008

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Experiment results

Increase of the initial population density enhances system resistance to antibiotics.
In our basic design, the EG cells can express ampicillin resistant protein constantly and kanamycin resistant protein by sensing the AHL which is given by the ER cells. And meanwhile the ER cell can express kanamycin resistant protein constantly and ampicillin resistant protein by sensing the BHL which is given by the EG cells.

By changing the inoculation concentration higher, the two different kinds of cells can help each other grew better. As shown in the graphs the final population of both of the two kinds of cells became higher and higher in the high antibiotics environment.

 

The initial concentration of ampicillin and kanamycin in the culture determined the least inoculating population of the EG and ER cells.

We did some comparisons under different condition to show the effect of mutualism.
The result shows that with the help of each other both of them can survive in some region either of them can not live alone.

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