Team:Chiba/Project/j

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(→時間スイッチ)
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発現時間の調節をするために、以下の要件が挙げられる。
発現時間の調節をするために、以下の要件が挙げられる。
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*インデューサーの合成速度を下げる。
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#インデューサーの合成速度を下げる。<Br>RBSの調整(B0030->B0033),コピー数の調整(5->300)
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:RBSの調整(B0030->B0033),コピー数の調整(5->300)
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#レセプタータンパク質の感度を下げる。<Br>クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる([[Team:Chiba/Reference/j|ref.3]])。
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*レセプタータンパク質の感度を下げる。
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*ex)( )内はシンターゼ
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:クオラムセンシングのクロストーク。生物によってAHLのアシル基が異なる([[Team:Chiba/Reference/j|ref.3]])。
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**P.aeruginosa->C4-AHL(RhlI)
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ex)()内はシンターゼ
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**V. fisheri->C6-3-oxo-AHL(LuxI)
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**A.tumefaciens->C8-3-oxo-AHL(TraI)
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**R.leguminosarum->C14-3-hydroxy-AHL(CinI)
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'''Construction'''(From BioBrick)
'''Construction'''(From BioBrick)
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:*Receiver
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::LuxR,LasR,CinR,RhlR
::LuxR,LasR,CinR,RhlR
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'''Cross-Talk Check'''
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#LuxR vs LuxI,LasI,CinI,RhlI
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'''RBS交換'''<Br>
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*既存のパーツ
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**Boo34+luxI<Br>
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*New parts
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**Boo33(weak)+luxI
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**Boo32(medium)+luxI
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**Boo31(weaker)+luxI
=='''入力'''==
=='''入力'''==

Revision as of 07:35, 2 September 2008

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Contents

イントロ

時間スイッチ

クオラムセンシングによる細胞間コミュニケーションを利用する。 発現時間の調節をするために、以下の要件が挙げられる。

  1. インデューサーの合成速度を下げる。
    RBSの調整(B0030->B0033),コピー数の調整(5->300)
  2. レセプタータンパク質の感度を下げる。
    クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる(ref.3)。
  • ex)( )内はシンターゼ
    • P.aeruginosa->C4-AHL(RhlI)
    • V. fisheri->C6-3-oxo-AHL(LuxI)
    • A.tumefaciens->C8-3-oxo-AHL(TraI)
    • P.aeruginosa->C10-3-oxo-AHL(VanI)
    • P.aeruginosa->C12-3-oxo-AHL(LasI)
    • R.leguminosarum->C14-3-hydroxy-AHL(CinI)

Construction(From BioBrick)

  • Sender(Autoinducer synthase)
LuxI,LasI,CinI,RhlI
  • Receiver
LuxR,LasR,CinR,RhlR

Cross-Talk Check

  1. LuxR vs LuxI,LasI,CinI,RhlI
  2. LuxI vs LuxR,LasR,CinR,RhlR

RBS交換

  • 既存のパーツ
    • Boo34+luxI
  • New parts
    • Boo33(weak)+luxI
    • Boo32(medium)+luxI
    • Boo31(weaker)+luxI

入力

出力

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