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企画のための予備知識調べ

間違っても訂正が入るので安心して書き込んでください。

とりあえずどんどん編集していってください。

①バイオブリックパーツを挙げる：福富、杉山

後々、画像ものっけていきます。 Sender signal

BBa_F1610　3OC6HSL Sender device (available,works)

BBa_F1610のregistry

LuxIを作ります。

3OC6HSLをシグナル分子として出します。

他に-butyryl-HSL,3OC14HSLを出すパーツもありますが、実際に働くかはわかりません。

また、構造が似ているため混信してしまう可能性あり。

signal receivers

BBa_F2620 input:3OC6HSL output:PoPs (available,works)

②入力の追従性を高めるためには？：冨永、香取

GFPのfolding時間について

'superfast' GFPという変異体のfolding時間は、1000秒ちょっと(in vitro)だ、というデータが載ってました。また、folding時間が短いのに加えて、unfoldしにくく、GFPとしての機能をほとんど損なわないものでもあるそうです。(Fisher AC, DeLisa MP (2008) Laboratory Evolution of Fast-Folding Green Fluorescent Protein Using Secretory Pathway Quality Control. PLoS ONE 3(6): e2351. doi:10.1371/journal.pone.0002351)

ルシフェリンをエネルギー源としてGFPを光らせる、「生物発光共鳴エネルギー移動（BRET、 Bioluminescence Resonance Energy Transfer）」という現象の利用(自ら光る蛍光タンパク質による高精度細胞イメージング技術の開発より)

ルシフェラーゼ濃度とルシフェリンの発光強度の関係には、両対数で直線になるものもある（promega:Renilla luciferase assay systemより）。ルシフェラーゼをGFPに結合させるので、foldingに時間がかかりすぎてしまう。

大腸菌による青色色素の合成

ＤＣＳ生産性放線菌(S. lavendulae)に特異的に存在する遺伝子：bpsA (blue-pigment synthetase A)を、大腸菌に導入することによって（４'－ホスホパンテテイニル基転移酵素遺伝子を挿入した発現ベクター（例えば、pSTV/svp）を同時に導入し、共発現させる必要あり）、青色色素（indigoidine）を合成させることができる。生成速度、分解速度は調査中。

③（入力に対して）リニアなプロモーターにはどんなのがある？：小林、久保

④読み出し可能な出力って？：井山、川崎

勉強会

今までの勉強会についての簡単なログです。

6/28/08 メール勉強会

色素について

6/26/08 第6回勉強会

5/30/08 Wiki講習会

5/03/08 第7回事例研究

5/02/08 第6回事例研究

5/01/08 第5回事例研究

4/28/08 第4回事例研究

4/25/08 第5回勉強会&第3回事例研究

4/22/08 第2回事例研究

4/18/08 第1回事例研究

4/17/08 第4回iGEM勉強会

4/14/08 第3回iGEM勉強会

4/11/08　第2回iGEM勉強会

4/09/08　第1回iGEM勉強会

「iGEMとはなにか？」
プレ事前研究