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Team:Chiba/Study
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企画のための予備知識調べ
- 間違っても訂正が入るので安心して書き込んでください。
- とりあえずどんどん編集していってください。
①バイオブリックパーツを挙げる ：福富、杉山
後々、画像ものっけていきます。
Sender signal
- BBa_F1610(available,works)
3OC6HSL Sender device
LuxIを発現→3OC6HSLをつくります。BBa_F1610のregistry
他に-butyryl-HSL,3OC14HSLを出すパーツもありますが、実際に働くかはわかりません。
また、構造が似ているため混信してしまう可能性あり。 AHL構造
Siganl receiver
- BBa_F2620(available,works)
Input:3OC6HSL Output:Pops
（利用法：ＧＦＰ合成BBa_T9002)
②入力の追従性を高めるためには？ ：冨永、香取
- GFPのfolding時間について
'superfast' GFPという変異体のfolding時間は、1000秒ちょっと(in vitro)だ、というデータが載ってました。また、folding時間が短いのに加えて、unfoldしにくく、GFPとしての機能をほとんど損なわないものでもあるそうです。(Fisher AC, DeLisa MP (2008) Laboratory Evolution of Fast-Folding Green Fluorescent Protein Using Secretory Pathway Quality Control. PLoS ONE 3(6): e2351. doi:10.1371/journal.pone.0002351)
- ルシフェリンをエネルギー源としてGFPを光らせる、「生物発光共鳴エネルギー移動（BRET、 Bioluminescence Resonance Energy Transfer）」という現象の利用(自ら光る蛍光タンパク質による高精度細胞イメージング技術の開発より)
ルシフェラーゼ濃度とルシフェリンの発光強度の関係には、両対数で直線になるものもある（promega:Renilla luciferase assay systemより）。ルシフェラーゼをGFPに結合させるので、foldingに時間がかかりすぎてしまう。
- 大腸菌による青色色素の合成
ＤＣＳ生産性放線菌(S. lavendulae)に特異的に存在する遺伝子：bpsA (blue-pigment synthetase A)を、大腸菌に導入することによって（４'－ホスホパンテテイニル基転移酵素遺伝子を挿入した発現ベクター（例えば、pSTV/svp）を同時に導入し、共発現させる必要あり）、青色色素（indigoidine）を合成させることができる。生成速度、分解速度は調査中。
③（入力に対して）リニアなプロモーターにはどんなのがある？ ：小林、久保
・2007東工大作成のハイブリットプロモーター。（ひとつはlac repressorで制御され、もう一方はAHLで活性化されます。） BBa_I751101
・アラビノースプロモーター
（・AHL、luxRの種類の選択により、pluxの発現強度とAHL濃度にリニアな関係が得られる。）
④読み出し可能な出力って？ ：井山、川崎
勉強会
- 今までの勉強会についての簡単なログです。
6/28/08 メール勉強会
- 色素について
6/26/08 第6回勉強会
5/30/08 Wiki講習会
5/03/08 第7回事例研究
5/02/08 第6回事例研究
5/01/08 第5回事例研究
4/28/08 第4回事例研究
4/25/08 第5回勉強会&第3回事例研究
4/22/08 第2回事例研究
4/18/08 第1回事例研究
4/17/08 第4回iGEM勉強会
4/14/08 第3回iGEM勉強会
4/11/08 第2回iGEM勉強会
4/09/08 第1回iGEM勉強会
- 「iGEMとはなにか？」
- プレ事前研究
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