Team:Paris/August 26

From 2008.igem.org

(Difference between revisions)
(PCR1)
(PCR2)
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Phusion=0,2µL<br>
Phusion=0,2µL<br>
-
=PCR2=
 
-
* pFliA (rbs) (O145-F / O144-R)
 
-
* pFliA (O145-F / O146-R)
 
-
* pFliA +Gene FliA (O145-F / O151-R)
 
-
----
 
-
 
-
'''Program: promoter'''<br>
 
-
'''''Denaturation :''''' <br>
 
-
98°C-5'<br>
 
-
'''''Cycling 1 (3X) :''''' <br>
 
-
98°C-10"<br>
 
-
55°C - 30''<br>
 
-
72°C-30"<br>
 
-
'''''Cycling 2 (30X) :''''' <br>
 
-
98°C-10"<br>
 
-
65°C-30"
 
-
72°C-30"<br>
 
-
'''''Elongation :''''' <br>
 
-
72°C-5'<br>
 
-
 
-
----
 
-
 
-
Vf=50µL<br>
 
-
H20=33,5µL<br>
 
-
Buffer5X=10µL<br>
 
-
dNTP=1µL<br>
 
-
O1=2,5µL<br>
 
-
O2=2,5µL<br>
 
-
Phusion=0,5µL<br>
 
=PCR3=
=PCR3=

Revision as of 11:17, 26 August 2008

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Contents

PCR

PCR1

  • pFlhDC (O111-F / O113-R)
  • Gene FlhDC (O134-F / O131-R)
  • pFlgB (O102-F / O103-R)
  • pFlhB (O108-F / O109-R)

Program: Gradient
Denaturation :
98°C-5'
Cycling 1 (3X) :
98°C-10"
Gradient 61°C +/-10°C - 30
72°C-30"
Cycling 2 (25X) :
98°C-10"
72°C-30"
Elongation :
72°C-5'


Vf=20µL
H20=13,4µL
Buffer5X=4µL
dNTP=0,4µL
O1=1µL
O2=1µL
Phusion=0,2µL


PCR3

  • PCRFliA1 (O143-F / O152-R)
  • PCRFliA2 (O153-F / O150-R)
  • PCRFliA3 (O148-F / O150-R)

Program: PCRFliA1
Denaturation :
98°C-5'
Cycling 1 (30X) :
98°C-10"
Gradient 66°C +/-6°C - 25
72°C-20"
Elongation :
72°C-5'

Program: PCRFliA2
Denaturation :
98°C-5'
Cycling 1 (3X) :
98°C-10"
Gradient 61°C +/-10°C - 25
72°C-20"
Cycling 2 (30X) :
98°C-10"
72°C-30"
Elongation :
72°C-5'

Program: PCRFliA3
Denaturation :
98°C-30'
Cycling 1 (2X) :
98°C-10"
72°C-30"
Cycling 2 (5X) :
98°C-10"
98°C->72°C low decreasing 1.0°C/s
72°C-30"
Elongation :
72°C-5'

Cloning of EnvZ*

Concentration measurement by Biophotometer

Name [DNA] in µg/mL A260/A280
EnvZ* 10 µg/mL 1.35
pSB1A2 17 µg/mL 1.02

Ligation