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| - | [[Team:Chiba |Home]] / [[Team:Chiba/Internal |Internal]] / [[Team:Chiba/News|おしらせ]] / [[Team:Chiba/Study|勉強会ログ]] / [[Team:Chiba/BS |BS]] / [[Team:Chiba/Graveyard|Graveyard]]
| + | <html><link rel="stylesheet" href="https://2008.igem.org/wiki/index.php?title=User:Maiko/chiba.css&action=raw&ctype=text/css" type="text/css" /></html> |
| | + | {| style="color:white;" cellpadding="3" cellspacing="3" border="0" width="100%" align="center" class="menu" | |
| | + | !align="center"|[[Team:Chiba/j|ホーム]] |
| | + | !align="center"|[[Team:Chiba/Team/j|メンバー紹介]] |
| | + | !align="center"|[[Team:Chiba/Project/j|プロジェクト紹介]] |
| | + | !align="center"|[[Team:Chiba/Parts/j|作成したDNAパーツ]] |
| | + | !align="center"|[[Team:Chiba/Internal|ノート]] |
| | + | |} |
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| - | すみません。あとでちゃんと編集します。
| + | ブレインストーミングのログです。 |
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| | + | 長すぎるので月ごとに分けました。 |
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| | + | 各自更新よろしくお願いします。 |
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| | + | ---- |
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| - | ブレインストーミングのログです。更新始めました。
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| - | 【第2回】4/18（金）
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| - | 記録者：井山佳美
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| - | 〈クーラーバクテリア〉香取
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| - | バクテリアでクーラーをつくりたい。出来れば暖まるのも。
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| - | スイッチを光にして、光合成。その光エネルギーを使えないか？
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| - | 問題点：どのように温度を下げるか
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| - | ・化学反応→吸熱反応式
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| - | ・力学的→圧力変化で？
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| - | ・風力→扇風機？海の波？鞭毛で風を起こす？
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| - |
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| - | 〈リモコン〉
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| - | リモコンで動くバクテリアができないか。
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| - | 赤外線でレセプター
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| - | ラジコンのようにある波長でタンブル。またある波長で進むというかんじ。
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| - | 〈湿気とりバクテリア ～ムシムシJapan！wetなのにdry～〉
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| - | 高分子のように水分を取り込めないか
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| - |
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| - | 〈圧力センサー〉福冨さん
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| - | outputは光るとか？
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| - | ①バイオフィルムで圧力センサー。押したら光る。
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| - | ②圧力を音の振動で代えられないか。夜光虫。
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| - | 音←→〔圧力〕・・・センシング---→output
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| - | 圧電体っぽい。
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| - | 押してトブル→光る。光ったまま。
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| - | 問題点：どうやってセンシング？
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| - |
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| - | 〈蒸気圧センサー〉富永さん
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| - | 蒸気圧で溶質の濃度変化を測定する。
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| - |
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| - | 〈味覚センサー〉小林さん
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| - | ①糖度計・・糖の濃度を測る。
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| - | ②様々な味でそれぞれ違った反応をする。
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| - | 辛み…カプサイシンとか？
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| - | うまみ…グルタミン酸？
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| - | 苦み
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| - | 上記の中の味覚で、タンパク質を破壊するようなものを使えばいいのではないか？
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| - | 問題点：センサー系はoutputが大事だが、それをどうするかがまだわからない。
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| - |
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| - | 〈みつばち〉
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| - | 女王バクテリアと働きバクテリアが存在。
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| - | 働きバクテリアは女王バクテリアに養分を運び分解。犠牲になる。
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| - | 女王バクテリアが分裂して増えると、１匹を残して他の女王バクテリアは自ら玉座から降り、働きバクテリアと同じになる。
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| - |
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| - | 〈海女さんバクテリア〉久保
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| - | レアメタルなどを体内に取り込み浮上。ガスを使う。
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| - | 海中に沈んだ個体を分解して取り込む。
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| - |
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| - | 〈絆創膏バクテリア〉久保
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| - | バイオフィルム。皮膚のような役目をする。
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| - | 菌で皮膚を再生。菌は傷口の血を吸う。
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| - |
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| - | 〈アリクジ ～アリとナメクジ～〉 杉山
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| - | バクテリアを蟻のように並ばせて光らせる。
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| - | バクテリアで組み体操をさせ、模様を作る。
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| - |
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| - | 〈表情変化〉 杉山
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| - | バクテリアで顔を作り、何かをきっかけにしてその表情が変化する。
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| - | バクテリア同士が連携しあうような複雑なプログラム。
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| - | 2次元でそれぞれの場所がわかる。
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| - |
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| - | 〈大腸菌電池〉
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| - | 大腸菌で発電。
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| - |
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| - | 〈夜光虫〉 福冨さん
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| - |
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| - | 〈民族移動〉富永さん
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| - | ３種類(a,b,c)の色のバクテリアを用意し、それぞれがa→b、b→c、c→aというようにお互いを追いかけてぐるぐる回る。
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| - | 応用法：回転を利用して発電できないか。
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| - | 課題：センサーは拡散しにくいものを使いたい。
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| - |
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| - | 〈ドラッグデリバリーシステム、バクテリアver.〉富永さん
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| - | 大腸菌の鞭毛で運ぶ仕組み。
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| - |
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| - | 〈光タイマー〉井山
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| - | ①アナログメモリ
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| - | 入力（光の積分値）でバクテリアの色が変化する。
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| - | ②特定の波長（ある色の分光など）に反応する
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| - | 特定の波長に引き寄せられ、目的地に達すると停止し発色。バクテリアの移動時間で光量を計測する。
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| - | 問題点（②について）：自然光は波長の幅が広い。特定の波長に反応させたいなら、一部分だけ照らして引き寄せたほうが良いのでは。
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| - | 応用法：光でダメになってしまう物の消費期限を表すタイマーにならないか。
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| - |
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| - |
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| - | 【第3回】4/19（金）
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| - | 記録者：井山佳美
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| - | 〈ゴミ分解〉川崎
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| - | ①紙→セルロース→グルコース
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| - | ②核燃料を分解
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| - | ③髪の毛（猫の毛玉）
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| - | ④石油とか
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| - |
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| - | 〈薬〉川崎
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| - | カプセルで体内へ。
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| - | 患部→治す→体内で消えるor排出される
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| - | 問題点：体に良い菌も攻撃してしまうのではないか？
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| - |
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| - | ミセルで体内を通れないか
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| - | または寒天などゲル状態でいけないだろうか
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| - | 問題点：pHが違うところで崩壊する。
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| - | 対象をどのように確認するのか
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| - |
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| - | 〔磁力に反応するバクテリア〕川崎
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| - | 磁力に引っ張られるというよりは、野鳥のように方向が自然にわかるバクテリア。
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| - | 応用法①：記録装置
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| - | ②：プロッピーやペースメーカーなどを磁力から守る。
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| - |
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| - | 〔消臭バクテリア〕川崎
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| - | 鞭毛で消臭？
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| - | 疑問：何を消臭したいのか。くさい分子の定義は？
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| - | （腐ったビールの臭いは既に解決済み）
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| - | 応用法：スーツにつける
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| - |
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| - | 〔糖分分解大腸菌〕川崎
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| - | セルロース→グルコース
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| - | 紙に大腸菌をかけると紙がとける。
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| - | 疑問：分解酵素の配列は？
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| - | 細胞内にどう取り込むのか
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| - | 分解された糖はどうなるのか
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| - | 代謝経路はどうなのか
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| - | 問題：イメージが悪すぎる。
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| - |
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| - | 〔発熱吸熱大腸菌〕川崎
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| - | 発熱や吸熱をおこなう大腸菌。
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| - | 風を鞭毛で起こす。（←先日の香取のクーラーバクテリアから）
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| - | 問題：鞭毛で風を起こすのはちょっと無理
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| - | 提案：蒸発熱は使えないだろうか
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| - |
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| - | 〔除湿〕
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| - | 結露を利用。ヒーターで乾燥。
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| - | 提案：フィルムにしたら湿布にならないか
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| - | 疑問：湿布の仕組みは？薬の作用は？
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| - |
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| - | 〔カビキラー大腸菌〕小林さん
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| - | 辛子はカビを抑制
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| - | 納豆菌でカビを抑制できないか。
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| - |
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| - | 〔金属・塩分濃度に反応する大腸菌〕
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| - | 固体の表面に反応物質を入れる。
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| - | 疑問：イオン化する→減るのか？
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| - | （↑イオン化に関して久保の海女さんバクテリアと同じ）
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| - | （↑塩分センサーは小林さんの味覚センサーに類似）
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| - |
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| - | 〔傷薬〕
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| - | バイオフィルムとして人口かさぶたをつくる。
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| - | 手術後の糸みたく、だんだんと消えていく。
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| - | 応用法：整形手術に使える
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| - |
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| - |
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| - | 【第４回】4/21(月) 小林・香取・井山班ログ
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| - | 記録者：井山佳美
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| - | 〔光メーター〕井山
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| - | ①光の積分値によって発色
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| - | 疑問：どのようにそのプログラムをつくるか
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| - |
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| - | ②光の強さによってアクションが違う
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| - | 分光→光源にむかって移動
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| - | 自然光→発色
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| - | この移動時間で光の当たった時間を計測できないか
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| - |
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| - | 応用：光で分解されてしまう物の消費期限メーター
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| - | 課題：光とは何なのか勉強すべき
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| - | 光で物が傷むとは？もうすこし具体的に
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| - | 問題：②の場合、大腸菌の動くスピードも調整しなければならない
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| - |
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| - |
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| - | 〔洗剤〕
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| - | 油をバクテリアがミセルのように包み込む
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| - |
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| - | 〔タイマー〕小林さん
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| - | 10回分裂したら死ぬバクテリア
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| - | バクテリアの一生の時間、細胞分裂の速さをコントロール
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| - |
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| - | 〔クーラー〕香取
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| - | 冷房用と暖房用、２種のバクテリアを作る
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| - | 提案：バクテリアがつくる水の蒸発熱を利用できないか
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| - |
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| - | 〔汗っかきの大食い大腸菌〕井山
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| - | グルコースの消費速度を上げれば、水の蒸発熱もそれだけ多く必要になるのでは？
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| - | その蒸発熱で周囲の温度を下げられないか？
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| - |
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| - | 〔発熱大腸菌〕
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| - | ①自発熱植物の遺伝子を組み込む
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| - | （稲の改良で既に使っている）
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| - | ②物質Ａに反応して、大腸菌が物質Ｂをだす。ＡとＢが反応し熱変化を起こす。
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| - |
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| - | 〔地震感知〕香取
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| - | 地震の予知をする大腸菌
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| - |
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| - | 〔ソムリエ大腸菌〕小林さん
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| - | うまみを感じて喜ぶ
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| - | 疑問：喜びの表現の仕方がわからない
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| - |
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| - | 〔しみとり〕
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| - | 服についたしみを食べてしまう大腸菌
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| - | 問題：しみの定義は？
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| - |
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| - | 〔磁力〕
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| - | 磁力にすいつく大腸菌。
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| - | 応用：コンパス、モーターを回して発電
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| - |
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| - |
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| - | 【第４回】4/21(月) 福冨・杉山班ログ
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| - | 記録者：杉山まい
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| - | ＊消臭
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| - | ・生ゴミの臭いを消す。
| |
| - | ・柑橘系のにおいを放出。
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| | | | |
| - | ＊臭いセンサー
| + | *4月のBSログ |
| - | ・臭くなって嫌がって動く。
| + | |
| - | ＊圧力センサー
| + | |
| | | | |
| - | ・大腸菌に迷路をとかせる。
| + | [[Team:Chiba/BS1 |BS-April]] |
| - | →大量(?)の大腸菌を迷路に誘導し、全ての道に進ませる。違った道は後で水を送って圧力をかける。
| + | |
| - | そうすると、大腸菌は光りだす。よって正しい道のみが光らない。（ほんとは逆にしたい）
| + | |
| - | ・光り方
| + | |
| - | →圧力をかけると死ぬor形が変形or力が分散（広範囲のみ？）
| + | |
| - | →大腸菌内にガスをため、圧力を吸収。ガスが抜ける＝光りだす（プチプチ）
| + | |
| - | ＊お見合い大腸菌
| + | |
| - | ・二つの大腸菌が体内から液を出して光りだす
| + | |
| - | →ぐろい
| + | |
| - | →浸透圧
| + | |
| - | →圧力センサー同様迷路の中に送り、出会ったら光る。
| + | |
| - | ＊みつばち大腸菌
| + | |
| - | ・女王様が細胞分裂ごとにでかくなる。
| + | |
| - | →目で見えるくらいにでかくしたい。
| + | |
| - | →寿命短い。
| + | |
| - | ＊分裂回数カウンター
| + | |
| - | ・細胞分裂するたびに異なった色の大腸菌ができる
| + | |
| - | →レインボー色
| + | |
| - | →細胞分裂の時間
| + | |
| - | →寿命
| + | |
| - | ＊文字書き大腸菌
| + | |
| - | ・シャーレ上で様々な色を感知して文字を浮かび上がらせる
| + | |
| - | →メッセージを残す
| + | |
| - | →大腸菌に文字を記憶させる
| + | |
| - | ＊充電池
| + | |
| - | 記録と記憶があいまいで、よくわかりません。。。
| + | |
| - | ＊日時計
| + | |
| - | ・光で１２色の色が順番にひかる
| + | |
| - | ＊壁を破る大腸菌
| + | |
| - | ・たとえば血管中に詰まった部分があったら、大腸菌たちが集まって
| + | |
| - | 分解酵素をだしてつまりを解消する。
| + | |
| - | →血管中だと死亡。
| + | |
| - | →詰まっている管でやる
| + | |
| - | thinkingを大切に、
| + | |
| - | 他大学のデスカッションを見てみる
| + | |
| - | input,outputを調べる
| + | |
| - |
| + | |
| | | | |
| - | ＊レアメタル
| |
| - | ・カプセル投下→海底→ガスでup・・・高圧下、高塩分濃度下ではどうなる？
| |
| - | ・酸放出orイオン化・・・how to?
| |
| - | →膜封入・・・膜だのみ？
| |
| - | ・調査項目
| |
| - | １、イオンの取り込み方
| |
| - | ２、高濃度＝死？
| |
| - | ３、対象物？
| |
| - | ・エンドサイトーシス
| |
| - | ・意義・・・レアメタル＝高価なので、海底からとり、安くget
| |
| - | 金属廃棄物
| |
| - | ・もし・・・宇宙で使います？
| |
| - | ・参考：MIT エディンバラ
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| - |
| |
| - | ＊みつばち
| |
| - | ・女王ばち→巨大化→死？寿命？
| |
| - | ・働き８がとってきたら女王８は「AHL」を放出→ファージで働き８死ぬ
| |
| - | （cf.ファージ：ライス ）
| |
| - | ・dead or alive をバイステーブルで。（cf,東工大＞北京）
| |
| - | ・新鮮さ、用途は？
| |
| - | ・女王８ｘ２で、どっちかが生き残る
| |
| - | →ランダム
| |
| - |
| |
| - | ＊ランダム
| |
| - | ・さむらい・・・thinking（計算等）を失敗→切腹
| |
| - | ・ゆらいでスイッチが入る
| |
| - | ・モデリングok?
| |
| - | ・カオス理論
| |
| - |
| |
| - | ＊クーラー
| |
| - | ・how to・・・食べて汗
| |
| - | →系の周りに影響はあるのか？
| |
| - | →逆では？
| |
| - | ・熱エネルギー、化学エネルギー（同化etc）
| |
| - | ・そもそも熱とは？
| |
| - | ・調査項目
| |
| - | →模倣品の原理
| |
| - | →そのような生き物はいるのか？
| |
| - |
| |
| | | | |
| - | 【第12回】5/10(土)
| + | *5月のBSログ |
| - | 記録者：久保喬義
| + | |
| - | 凡例
| + | |
| - | ①原案
| + | |
| - | ②出された意見、質問→回答
| + | |
| - | ③現時点での課題、問題点
| + | |
| | | | |
| | + | [[Team:Chiba/BS2 |BS-May]] |
| | | | |
| - | 杉山案（パターン形成）
| |
| | | | |
| - | ①・光が当たったとき波長（赤と青の二種類）に応じて大腸菌に異なるパターン（表情）を表現させる
| + | *6月のBSログ |
| - | ・各色に反応する大腸菌をそれぞれ用意（二タイプの大腸菌）
| + | |
| - | ②・二つの光が同時に当たったときはどうするか→第三のパターンを形成させる
| + | |
| - | ・フォトマスクは使うのか→フォトマスクの代わりに格子状の仕切でパターンを作る
| + | |
| - | ・一種類の大腸菌で両方の色に反応させるようにしてはどうか→分けた方がいい
| + | |
| - | ③・全体的にまだ調査が必要
| + | |
| - | ・青の波長に反応するセンサーは新造する必要あり
| + | |
| | | | |
| | + | [[Team:Chiba/BS3 |BS-June]] |
| | | | |
| | | | |
| - | 川崎案（写真のフィルム）
| + | *7月のBSログ |
| | | | |
| - | ①・光が当たったときに写真のフィルムとして機能するバクテリア
| + | [[Team:Chiba/BS4 |BS-July]] |
| - | ・単一の波長に反応するバクテリアを三種類（R,G,B）作りそれぞれを層にして重ねる（写真のフィルムの三層構造）
| + | |
| - | ②一層にしないと酸素の供給で問題が出るのでは → 一層に変更
| + | |
| - | ③・三原色に反応する機構や発色の仕組みの調査、考案
| + | |
| - | ・センサー部分（青と緑の波長に反応）の新造
| + | |
| - | ・in put のシステムの具体化
| + | |
| - | ・過去の事例の調査
| + | |
| | | | |
| | | | |
| - | | + | {| style="color:white;" cellpadding="3" cellspacing="3" border="0" width="100%" align="center" class="menu" | |
| - | 福冨案（"ランダム"の利用）
| + | !align="center"|[[Team:Chiba/j|ホーム]] |
| - | | + | !align="center"|[[Team:Chiba/Team/j|メンバー紹介]] |
| - | ①・乱雑さを作り出す機構を利用して大腸菌の行動に幅を持たせる（入力の変化に応じた出力の変化）
| + | !align="center"|[[Team:Chiba/Project/j|プロジェクト紹介]] |
| - | ・トグルスイッチとランダム発生機構を組み合わせる
| + | !align="center"|[[Team:Chiba/Parts/j|作成したDNAパーツ]] |
| - | ・in put は環境の変化
| + | !align="center"|[[Team:Chiba/Internal|ノート]] |
| - | ・可逆的な変化をより簡単に引き起こさせるのが目的
| + | |} |
| - | ②ランダムの仕組みは? → 翻訳の方向の決まり方に関する部分を利用（次回詳しく説明か?）
| + | |
| - | ③・プロの研究者が既にやっている可能性あり（新規性の問題?）
| + | |
| - | ・もっと簡単な仕組みで乱雑さを発生させられる可能性あり
| + | |
| - | | + | |
| - |
| + | |
| - | | + | |
| - |
| + | |
| - | 【第13回】5/12（月）
| + | |
| - | 記録者：井山佳美・杉山まい
| + | |
| - | 【前半記録・井山佳美】
| + | |
| - | | + | |
| - | 「Random Generator」：小林
| + | |
| - | | + | |
| - | 光や化学物質等の１つの刺激で、２つのプロモーターを動かしてそれぞれお互いのプロモーターを制御するタンパク質を出現させる。刺激が加わってから、２つのうちのどちらが早く相手のスイッチをoffにするのかという確率を１：１に設定し、どちらが制御させるかがランダムになっている。
| + | |
| - | | + | |
| - | 確率が五分五分になっていなければならないので、
| + | |
| - | | + | |
| - | 分子量、転写領域測定速度、転写開始速度、翻訳開始速度、folding速度
| + | |
| - | | + | |
| - | などの様々な要素を調節する必要がある。そのため、このステップを減らすために２つのプロモーターからだされるタンパク質を同じタンパク質としたい。ただし、自己と非自己のタンパク質を認識するようにする。
| + | |
| - | | + | |
| - | 疑問：自己と非自己のタンパク質を認識できるようにするためにはどのようにすればいいのか
| + | |
| - | | + | |
| - |
| + | |
| - | | + | |
| - | 「じゃんけん」：福冨
| + | |
| - | | + | |
| - | 光や化学物質等の１つの刺激で、２つのプロモーターを動かしてそれぞれお互いのプロモーターを制御するタンパク質を出現させる。刺激が加わってから、２つのうちのどちらが早く相手のスイッチをoffにするのかという確率を１：１に設定し、どちらが制御させるかがランダムになっている。
| + | |
| - | | + | |
| - | ここでoutputされるのは２種類のカギであり、CⅠを出現させる２つの別々の回路（PlacとPtet）に配列されている鍵穴にそれぞれ対応するようになっている。
| + | |
| - | | + | |
| - | このCⅠを出現させる回路にはlacI(IPTGで制御解除)とtetR(aTcで制御解除)が組み込まれており、CⅠのoutputが制御されている。（CⅠがなければ、大腸菌はファージに殺されてしまう。）
| + | |
| - | | + | |
| - | そこでA(-IPTG,-aTc)B(+IPTG,-aTc)C(-IPTG,+aTc)の三種類のシャーレを用意して、刺激を与えた大腸菌を中に入れてから、ファージを加える。
| + | |
| - | | + | |
| - | 制御解除ができないAではどちらにせよ大腸菌は死んでしまうが、BとCに関しては大腸菌の生死が以下のようになっており、どちら側のカギが生成させるかに左右される。
| + | |
| - | | + | |
| - | Plac側 Ptet側
| + | |
| - | | + | |
| - | A × ×
| + | |
| - | | + | |
| - | B ○ ×
| + | |
| - | | + | |
| - | C × ○
| + | |
| - | | + | |
| - |
| + | |
| - | | + | |
| - |
| + | |
| - | | + | |
| - | 「迷路を泳ぐ大腸菌」：冨永
| + | |
| - | | + | |
| - | AとBそれぞれに向かって泳ぐ回路を作成し、トグルスイッチによりその動作を交互に行わせる。
| + | |
| - | | + | |
| - | 細胞間を移動することができるトランスポーターのようなものをつくれないか。
| + | |
| - | | + | |
| - | AとBをどのように配置するかが問題。濃度勾配を作るのが難しく拡散してしまう恐れがある。
| + | |
| - | | + | |
| - |
| + | |
| - | | + | |
| - | 「大腸菌攪拌機」：香取
| + | |
| - | | + | |
| - | 膜タンパクを利用して大腸菌をバーに結合させて、様々な無機に回転させる。この回転を液体の攪拌機として利用したい。
| + | |
| - | | + | |
| - | 高温に反応する菌と、低温に反応する菌を作ることで、回転する温度帯の幅を広げる。
| + | |
| - | | + | |
| - | | + | |
| - | | + | |
| - | | + | |
| - | 【後半記録・杉山まい】
| + | |
| - | | + | |
| - | 「積分値」：井山
| + | |
| - | 光を感知する大腸菌と感知した大腸菌がoutputとしてHSLを出す。
| + | |
| - | 出されたHSLをinputとする大腸菌が色素を出してどれだけの光を感知したか
| + | |
| - | を調べる。
| + | |
| - | | + | |
| - | 利用法：input=アレルギーの原因物質として喘息などの予防
| + | |
| - | | + | |
| - | 疑問：積分値を出す大腸菌は色素を出すのだが、どのような色素を利用していくのか？
| + | |
| - | （分解性の色素だと積分値としてたまらないのでNG）
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| - | ex:リコペン
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| - | 「二面相大腸菌」：杉山
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| - | 青の光を感知する大腸菌（①）、赤の光を感知する大腸菌（②）を顔の形に配置し、
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| - | 光を当て二種類の顔を作り出す。
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| - | ①、②それぞれ感知しない光のときは色素を出さない。
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| - | そのために分解性のある色素を使用していく。
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| - | 青の光を感知する大腸菌は創り出す必要がある。
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| - | 疑問：分解性の色素とは？
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| - | 例えばカロテノイドのとき、分解の速さは？
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| - | 光の受け方の仕組み（cf光合成細菌）
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| - | 【第14回】5/15(木)
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| - | 記録者：杉山まい・井山佳美
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| - | 【前半記録者・杉山まい】
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| - | 「花粉除去」：杉山案
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| - | スギ花粉を複数の大腸菌が取り囲み、取り囲んだことを確認するため、発光する。
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| - | スギ花粉は外皮の蛋白質、中身の炭水化物、アミノ酸、蛋白質などからできている。
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| - | 花粉症になる原因は、湿度が加わるとスギ花粉の外皮蛋白質が拡散し、
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| - | アレルギーの原因である、内部の糖蛋白質が漏出するためである。
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| - | ・どのように囲むか？
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| - | →膜タンパクでつつみこむ
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| - | →FLIC（cf.chiba07まりも）：鞭毛を構成するタンパク質（FliC）を用いて糖タンパク質へ吸着させる。
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| - | ・発光の順番
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| - | →ある程度近づくことによって大腸菌に発光する蛋白質をつくらせ、
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| - | 周りを囲むのが完了したあたりで発光する。
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| - | ・調査事項
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| - | →アレルギーの原因である糖タンパク質のについて
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| - | →花粉センサーについて（cf.chiba06)
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| - | →用途
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| - | 「ランダムスイッチ」：福富案
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| - | 今までのスイッチはトグルスイッチのように「2つの状態のうちどちらかをとる」という遺伝子回路が多く存在している。
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| - | トグルスイッチ（GFP,RFP発光）にHin,Hixシステムを利用して、ランダム（５０：５０）だったものを７０：３０のように発現の割合を変化させていく。
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| - | 実験方法としては、IPTG,aTcが入っている、または入っていないシャーレの中に大腸菌を入れ、
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| - | 発現の割合を変えて色を観察する。
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| - | ・ランダム化機構
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| - | ―←（Lacl)-○-Hix-→(プロモーター)-Hix-○―→（tetR)
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| - | のような遺伝子回路をつくり、Hix間のプロモーター
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| - | の向きを反転させ、発現を変化させる。
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| - | ・発展
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| - | →トグルスイッチと積分大腸菌（井山案）を合わせて、感知大腸菌、積分大腸菌の割合を変化させていく。
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| - | （ex,感知する光が多いとき感知菌を増やし、光が少なければ菌をへらす）
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| - | →まりも
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| - | （GFP,RFPをAHL sender,receiverとしAHLを感知し菌同士がくっつきあいマリモ化していく）
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| - | →濃度変化読み取り
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| - | （濃度の違った領域を大腸菌に進んでもらい濃度によって色が変わる）
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| - | ・用途・・・何に使えるかわからず。
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| - | 【後半記録・井山佳美】
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| - | 「写真大腸菌」：川崎案
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| - | 光の三原色に発光する大腸菌を３層に敷き詰めて、写真を作りたい。
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| - | 色素も考えたが、下層フィルムまで光が届かなくなる可能性があるため、蛍光タンパク質を使う。
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| - | これができれば2千万画素数のスーパーハイビジョン写真が作れる。
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| - | 問題としては、どのようなフィルムが向いているのか、またフィルムで仕切っても大腸菌の具合は大丈夫なのかがまだわかっていない。
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| - | 【第1回テーマ絞り込み会議】5/16（金）
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| - | 記録者：杉山まい・川崎浩平
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| - | 【前半記録・杉山まい】
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| - | 「積分値」：井山案
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| - | 積分値＝単位時間当たりで計測（値をためたまま、次回には影響が出ないように）
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| - | 感知菌、積分値菌の調節も必要だが、
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| - | そもそも大腸菌で「積分値」を計らせるということは今までなかったので、ここが新しい。
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| - | ☆new積分値計算方法
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| - | pseudotaxis cheWを使用していく。
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| - | cheW：大腸菌がまっすぐ進むために必要なパーツ。なければその場でとどまっているだけ。
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| - | シャーレ上にcheWを右に行けば行くほど濃度を濃くして大腸菌を進ませる。その進んだ距離を積分値として出す。
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| - | 「二面相大腸菌」：杉山案
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| - | 異なる光を当てて顔を浮かばせるのではなく、
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| - | 霧吹きなどで化学物質を吹きかけて顔を浮かび上がらせる。
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| - | 異なる顔にすることでアニメーション性が生まれる。
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| - | 「Random Generator」＆「ランダムトグルスイッチ」：小林、福富案
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| - | ・ランダムにすることに関して
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| - | 全ての最近が同じ割合で反応を進めるとまずい。
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| - | プラスミドだと割合を決めるものが多く、ゲノムではどうか？
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| - | 【後半記録・川崎浩平】
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| - | 写真大腸菌
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| - | 疑問点
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| - | ・3層にする意味は？一層にして赤青緑の波長に反応する大腸菌混ぜればいいのではないか。
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| - | →
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| - | ・写真という枠を取っ払って3層のそれぞれに違った機能を持たせそれぞれの間でコミュニケーションさせてみる？←信号を伝える仕組み、具体的に何をさせるかまでは至らず。
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| - | ・杉山案（二面相大腸菌）との合体もあり得る
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| - | 〈必要なこと〉
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| - | ・写真にするならば青に反応する大腸菌の作製、すでに出来ているならば使用可能か
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| - | ・3層にするならばそれぞれの層の大腸菌が混ざらないように仕切るフィルムのようなもの、3層構造を上手く利用したシステム
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| - | 【第2回テーマ絞り込み会議】5/19（月）
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| - | 記録者：杉山まい・井山佳美
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| - | A(画像）、B（積分）、C（ランダム）、D（大腸菌ブレンダー）、E（メタルイータ）
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| - | 今までの企画をまとめて 5つのテーマにした上で、それぞれの最高到達点のレベルについて話合いました。
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| - | 【最高到達点のレベル：以下の様なことが多いほど良い】
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| - | ○友人へアピールできる志の高いゴール
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| - | ○世界のiGEMersに埋もれない斬新さ
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| - | ○生物/細胞工学におけるインパクト
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| - | ○いぶし銀のこだわり
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| - | A（画像）
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| - | 〔光にこだわる〕 ～光に特化しても良いのではないか～
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| - | ・赤色の精度を上げる（斬新さはないが、使い勝手のいい赤色を作ることにいぶし銀を感じる）
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| - | ・ 青色センサーをつくる（以前に作ろうとした事例があるが、まだ完成していないためインパクトはある）
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| - | 〔画像にこだわる〕 ～やはり画像で～
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| - | ・ 超高画質の画像
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| - | ・３D（溶液内に立体的な絵を描く）
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| - | ・movie
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| - | ・液面に絵を描く
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| - | B（積分）
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| - | ・ 感知菌だけでなく、積分菌の表現方法も多様化させる。
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| - | （感知するモノに合わせて、色・移動・蓄積などの積分表現を使う。）
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| - | C（ランダム）
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| - | ・わざとランダムにする用途→ゲーム又は賭け事？
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| - | AとCのコラボ
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| - | クイズ形式にして、答えの画像を載せる。また、答えの画像にモザイクをかけるためランダムをつかって色をばらばらにする。答えの画像のみを出すときは、ランダム大腸菌に何かinputをして色を消す。
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| - | AとBのコラボ
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| - | 積分値の値によって、異なる発色をさせる。（例：totalα→赤発色、totalβ→青発色、〔α＜β〕）この発色をさせる際に画像を組み込めればおもしろいのではないか。
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| - | 【第15回ブレインストーミング】5/22（木）
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| - | 記録者：杉山まい
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| - | 【第16回ブレインストーミング】5/24（土）
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| - | 記録者：杉山まい
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| - | 土曜日は、前行ってたとうり、
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| - | テーマの起承結を作ってみよう
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| - | という感じです。（転は結がおこってからだそうです）
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| - | 画像（杉山）
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| - | 起：人類は生きてきた証を絵として残してきた。それは静止画から動画へと進み、現在ではより美しい画像を求めている。
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| - | 承：過去のiGEMでは光を当てれば、絵が浮かび上がってくる大腸菌が作られた（表現いまいち）
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| - | 結：従来のiGEMでは一度絵が浮かび上がればそれで終了で、新たな絵を描くためには別のプレートが必要だった。そこで、分解性の色素を出すことで何度も書くことのできる大腸菌を作ろう。
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| - | このように、作りました。多少言ったことが違っているかもしれんのですが・・・
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| - | 上のストーリーについて
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| - | ・具体的には？
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| - | →色に重き・・・何色？何の絵にするのか？
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| - | →動きに重き・・・顔の作りかた？2つの顔はどんなときに区別？
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| - | 動きの種類（なにも顔じゃなくても良いんじゃね?ってことで）
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| - | ・福笑い→顔が違う場所に移動？（香取案、詳しくは香取君にお問い合わせください）
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| - | ・植物が芽を出して育つ様子を描く（原理は忘れました。詳しくは香取君まで）
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| - | 福冨さんの案（画像×ランダム）、小林さんの案（じゃんけん）
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| - | についてやりました。
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| - | 【第17回ブレインストーミング】5/26（月）
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| - | 記録者：杉山まい
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| - | 「モザイク×画像」香取案
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| - | 起：近年、パソコンが使われるようになってきた＝顔が見えない
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| - | 承：過去のiGEMは顔が見える＝ひねりがない
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| - | 結：最初は見えないが、何かのアクションで見えるようにする
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| - | 三層イラスト
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| - | 上：モザイク
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| - | 中：絵A
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| - | 下：絵B 絵A＋絵B＝絵C（二つの絵を重ねることによって新しい絵ができる）
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| - | inputして・・・ ①モザイク分解→絵C見える
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| - | ②モザイク、A分解→絵B見える
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| - | ③モザイク、B分解→絵A見える
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| - | ④全部分解→はずれ？
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| - | という４つのoutputが存在（ユニークさ）
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| - | ＊inputしてからoutputがどれになるかはランダム
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| - | →絵の一部だけ残ってしまうのでは？
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| - | ＊分解酵素は？
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| - | 「ランダムさ」冨永案
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| - | 起：今まではプログラム通りなものがアトムのような人工（thinking）ロボット
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| - | 承：過去iGEMは選択を重視していない
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| - | 結：道を考えて選ぶ
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| - | | + | |
| - | 分かれ道があり、A,Bが濃度別に流れている。
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| - | トグルスイッチｘHin/Hixによってどちらの濃度勾配が濃いほうに行くのか決める
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| - | →前の分岐点の結果を考えて進む
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| - | ＊見せ方は？
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| - | ＊最終的には？
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| - | 【第18回ブレインストーミング】5/28（木）
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| - | 記録者：久保喬義
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| - | マーブル（福富案）
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| - | 要件
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| - | ・３種類のバクテリアと２種類のシグナル用分子を用いたマーブル模様の作成
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| - | <構成要素>
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| - | バクテリアα
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| - | ・シグナルAを受け取ると緑になり、さらにシグナルAを出す
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| - | ・シグナルBを受け取ると赤になる、さらにシグナルBを出す
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| - | ・緑の状態でBを受け取ると黄色になる
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| - | ・赤の状態でAを受け取ると青になる
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| - | バクテリアβ
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| - | ・シグナルAを出す
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| - | バクテリアγ
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| - | ・シグナルBを出す
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| - | シグナルA
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| - | シグナルB
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| - | <仕組み>
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| - | ① バクテリアαは培地上に均一に分布している
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| - | ② βとγの混合液は薄めて個体密度が低くなるようにする
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| - | ③ ②の混合液を①の培地に撒く
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| - | ④ αがシグナルAやBを受け取って発色する
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| - | ⑤ AやBが不均一に分布していれば発色の仕方も不均一になってマーブルになる?
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| - | 【アドバイス内容】6/12（木）
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| - | 記録者：
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| - | 【第23回ブレインストーミング】6/14（土）
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| - | 記録者：
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| - | Powered by FC2.com
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| - | [[Team:Chiba |Home]] / [[Team:Chiba/Internal |Internal]] / [[Team:Chiba/News|おしらせ]] / [[Team:Chiba/Study|勉強会ログ]] / [[Team:Chiba/BS |BS]] / [[Team:Chiba/Graveyard|Graveyard]]
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