Team:Chiba/protocol/j

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形質転換

形質転換（通称：トラフォ）とは？

外部からDNAを加えて、その生物の性質を変える操作のことです。

アイジェムチバ2008では、XL10GOLD，BW35113，などの大腸菌株を使用しています。

Z コンピ

Z-Competentcellsを使った形質転換のプロトコル。

エレクトロポレーション

アイジェムチバ2008では使用履歴なし。

DNA精製

DNA精製（通称：ミニプレ）とは？

スモールスケールで生物からプラスミドを精製することです。

シグマプレップ

Sigma Miniprep kit によるDNA精製プロトコル

キアプレップ

QIAprep Spin Miniprep kit によるDNA精製プロトコル

ザイモDNAクリーン

ライゲーション過程などで必要不可欠なザイモクリーンのプロトコルです。

アガロースゲル電気泳動

アガロースゲル電気泳動（通称：ゲル電）とは？

DNAを分離する手法のことです。

さまざまな実験操作後で、DNAの長さを確認する際によく使います。またライゲーションのためのゲル抽出の際にも行う操作です。

経験を積むほど素敵なゲルを作成することができます。職人の知恵と力量が試されます。簡単に言うときれいなゲルほど良いバンドがでるんです。

アガロースゲル電気泳動

アガロースゲル作成から、DNAバンド観察までのプロトコルです。

ポリメラーゼ連鎖反応

ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）とは？

DNAを増幅させる手法のことです。

これを使えばたったの2時間で目的の部分のDNAを増幅させることができます。

PCR

卓上型PCR装置を使ったPCR法のプロトコルです。

ダイジェスチョン

DNAを制限酵素によって切断します。ライゲーションやDNAの長さを確認するために必要不可欠な操作です。

ライゲーション

ゲル抽出

アガロースゲル電気泳動後にそのゲルからDNAを抽出する操作です。

DNA脱リン酸化

SAP(Shrimp Alkaline Phosphetase)処理とは？

Self ligationなどの目的以外のサイト同士の結合も、リン酸基が残っているとおきてしまいます。これらの反応は少なくともligation反応を阻害する反応です。特にベクターだけのSelf ligationは目的のDNAが含まれていなくても、oriやマーカーがDNAに含まれているため、菌内で増殖し、かつ、抗生物質も効かないプラスミドができてしまいます。

これを防ぐためにベクター側のリン酸基を処理しようというのが、ここで紹介するプロトコルになります。

DNAリン酸化

アイジェムチバ2008では未使用。

ライゲーション

ダイジェスチョンなどで作成した複数のDNA断片を組み替えてつなげる操作です。

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->[[Team:Chiba/Internal]]
+<html><link rel="stylesheet" href="https://2008.igem.org/wiki/index.php?title=User:Maiko/chiba.css&action=raw&ctype=text/css" type="text/css" /></html>
+>[[Team:Chiba/Internal|ノートに戻る]]
+== 形質転換==
+*形質転換（通称：トラフォ）とは？
+:外部からDNAを加えて、その生物の性質を変える操作のことです。
+:アイジェムチバ2008では、XL10GOLD，BW35113，などの大腸菌株を使用しています。
+===[[Team:Chiba/protocol/transformation/j|Z コンピ]] ===
+Z-Competentcellsを使った形質転換のプロトコル。
+===エレクトロポレーション===
+アイジェムチバ2008では使用履歴なし。
-== 形質転換 ==
-===[[Team:Chiba/protocol/transformation|Z コンピ]] ===
-===[[Team:Chiba/protocol/transformation|エレクトロポレーション]]===
 == DNA精製 ==
-===[[Team:Chiba/protocol/DNA_Purification/sigma|シグマプレップ]]===
+*DNA精製（通称：ミニプレ）とは？
-===[[Team:Chiba/protocol/DNA_Purification/zymocleam|ザイモDNA クリーン&コンセントレイター]]===
+:スモールスケールで生物からプラスミドを精製することです。
+===[[Team:Chiba/protocol/DNA_Purification/sigma/j|シグマプレップ]]===
+Sigma Miniprep kit によるDNA精製プロトコル
+===[[Team:Chiba/protocol/DNA_Purification/qia/j|キアプレップ]]===
+QIAprep Spin Miniprep kit によるDNA精製プロトコル
+===[[Team:Chiba/protocol/DNA_Purification/zymocleam/j|ザイモDNAクリーン]]===
+ライゲーション過程などで必要不可欠なザイモクリーンのプロトコルです。
-== [[Team:Chiba/protocol/gelcheck|アガロースゲル電気泳動]] ==
+== アガロースゲル電気泳動 ==
+*アガロースゲル電気泳動（通称：ゲル電）とは？
+:DNAを分離する手法のことです。
+:さまざまな実験操作後で、DNAの長さを確認する際によく使います。またライゲーションのためのゲル抽出の際にも行う操作です。
+:経験を積むほど素敵なゲルを作成することができます。職人の知恵と力量が試されます。簡単に言うときれいなゲルほど良いバンドがでるんです。
+===[[Team:Chiba/protocol/gelcheck/j|アガロースゲル電気泳動]]===
+アガロースゲル作成から、DNAバンド観察までのプロトコルです。
+== ポリメラーゼ連鎖反応 ==
+*ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）とは？
+:DNAを増幅させる手法のことです。
+:これを使えばたったの2時間で目的の部分のDNAを増幅させることができます。
+===[[Team:Chiba/protocol/PCR/j|PCR]]===
+卓上型PCR装置を使ったPCR法のプロトコルです。
+==ダイジェスチョン==
+=== [[Team:Chiba/protocol/digestion/j|ダイジェスチョン]] ===
+DNAを制限酵素によって切断します。ライゲーションやDNAの長さを確認するために必要不可欠な操作です。
-== [[Team:Chiba/protocol/digestion|ダイジェスチョン]] ==
-== [[Team:Chiba/protocol/PCR|PCR]]==
 == ライゲーション ==
-===[[Team:Chiba/protocol/ligation/gelex|ゲル抽出]]===
+===[[Team:Chiba/protocol/ligation/gelex/j|ゲル抽出]]===
-===[[Team:Chiba/protocol/ligation/dephosphorylation|DNA脱リン酸化]]===
+アガロースゲル電気泳動後にそのゲルからDNAを抽出する操作です。
-===[[Team:Chiba/protocol/ligation/phosphorylation|DNAリン酸化]]===
-===[[Team:Chiba/protocol/ligation/ligation|ライゲーション]]===
+===[[Team:Chiba/protocol/ligation/dephosphorylation/j|DNA脱リン酸化]]===
+*SAP(Shrimp Alkaline Phosphetase)処理とは？
+:Self ligationなどの目的以外のサイト同士の結合も、リン酸基が残っているとおきてしまいます。これらの反応は少なくともligation反応を阻害する反応です。特にベクターだけのSelf ligationは目的のDNAが含まれていなくても、oriやマーカーがDNAに含まれているため、菌内で増殖し、かつ、抗生物質も効かないプラスミドができてしまいます。
+:これを防ぐためにベクター側のリン酸基を処理しようというのが、ここで紹介するプロトコルになります。
+=== DNAリン酸化 ===
+アイジェムチバ2008では未使用。
+===[[Team:Chiba/protocol/ligation/ligation/j|ライゲーション]]===
+ダイジェスチョンなどで作成した複数のDNA断片を組み替えてつなげる操作です。
+== フェノタイプチェック ==
+===[[Team:Chiba/protocol/phenotype/T9002/j|T9002 protocol]]===
+===[[Team:Chiba/protocol/phenotype/timedelay/j|time-delay protocol]]===
+{| style="color:white;" cellpadding="3" cellspacing="3" border="0" width="100%" align="center" class="menu" |
+!align="center"|[[Team:Chiba/j|ホーム]]
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From 2008.igem.org

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Contents

形質転換

エレクトロポレーション

DNA精製

アガロースゲル電気泳動

ポリメラーゼ連鎖反応

ダイジェスチョン

ライゲーション

DNAリン酸化

フェノタイプチェック