Team:Chiba/jk

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<html><link rel="stylesheet" href="https://2008.igem.org/wiki/index.php?title=User:Maiko/chiba.css&action=raw&ctype=text/css" type="text/css" /></html>
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[[Image:Chiba-U.gif|center]]
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{| style="color:white;" cellpadding="3" cellspacing="3" border="0" width="100%" align="center" class="menu" |
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!align="center"|[[Team:Chiba/j|ホーム]]
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!align="center"|[[Team:Chiba/Team/j|メンバー紹介]]
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!align="center"|[[Team:Chiba/Modeling/j|モデリング]]
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|}
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'''[[Team:Chiba/jk/a|α-Team]]'''
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<table border=0 width="100%"><tr><td width="65%" valign="top"><div style="background:#aaaaaa;padding:3px;">
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*シグナル分子システム作成班
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<!-- 左側コンテンツのタイトル -->
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:*冨永将大 Masahiro Tominaga
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カレンダー
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:*川崎浩平 Kohei Kawasaki
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</div><div style="background:#dddddd;padding:5px;">
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:*久保喬義 Takayoshi Kubo
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<!-- 左側コンテンツの内容 -->
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:*杉山まい Mai Sugiyama
+
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*調べたこと
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{|  align="center"
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:*phnolの溶解度8.8mg[http://en.wikipedia.org/wiki/Phenol [1]]
+
{| style="color:#0c6;" cellpadding="2" cellspacing="1" border="1" bordercolor="#800000" width="60%" align="center"
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:*tyrosineからphenolを合成する反応[http://www.kegg.jp/dbget-bin/www_bget?rn:R00728 [R00728]]
+
!align="center"|{{#calendar: title=Team:Chiba/Calendar-Home |year=2008 | month=08}}
-
:*TPL(Tyrosine Phenol-Lyase)の原典
+
!align="center"|{{#calendar: title=Team:Chiba/Calendar-Home |year=2008 | month=09}}
-
::*Kumagai, H.,and H. Hideki.Tyrosine Phenol Lyase Purification Crystallization,and Properties :''Biol.Chem''.,'''245''',No.7,1767-1772,1970
+
|}
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:::TPL(''Escherichia intermedia'' A-21由来)の特性について.以下の項目について説明があります。
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{| style="color:#0c6;" cellpadding="2" cellspacing="1" border="1" bordercolor="#800000" width="60%" align="center"
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:::*stability
+
!align="center"|{{#calendar: title=Team:Chiba/Calendar-Home |year=2008 | month=10}}
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:::*stoichiometry
+
!align="center"|{{#calendar: title=Team:Chiba/Calendar-Home |year=2008 | month=11}}
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:::*sedimentation coefficient(20℃,water)= 7.77
+
|}
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:::*diffusion coefficient(20℃,water)=4.42×10<sup>-7</sup>cm<sup>2</sup>/sec
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:::*Michaelis constant = 2.31×10<sup>-4</sup> M　(基質はL-tyrosine)
+
-
:::*inhibitor(L-alanine)  K<sub>i</sub>=6.53×10<sup>-3</sup> M
+
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:::*inhibitor(phenol)    K<sub>i</sub>=3.56×10<sup>-5</sup> M
+
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::*Kumagai, H.,and H. Hideki.Tyrosine Phenol Lyase Coefector Requirements:''Biol.Chem''.,'''245''',No.7,1773-1777,1970
+
-
:::TPLはピリドキサルリン酸(PLPA)がないと不活性である。また、最大活性を示すには、K<sup>+</sup>およびNH<sub>4</sub><sup>+</sup>が必要。Na<sup>+</sup>により不活性化。など、TPLの機構についての説明があります。
+
-
:*Nick J. P. Wierckx,* Hendrik Ballerstedt, Jan A. M. de Bont, and Jan Wery.Engineering of Solvent-Tolerant Pseudomonas putide S12 for Bioproduction of Phenol from Glucose:''Appl. Environ. Microbiol.'','''71''',No.12,8221-8227,2005
+
-
::グルコースからチロシン経由でpseudomonas putide S１２で２５時間後にフェノールを１．５ｍＭ生成。オクタノールの媒質二相で100時間後にフェノールを５８ｍＭ生成
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:*tyrosine biosynthesis pathway [http://www.kegg.jp/dbget-bin/get_pathway?org_name=ppu&mapno=00400 Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis - Pseudomonas putida KT2440]Pseudomonas putida S12では出ませんでした。
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'''[[Team:Chiba/jk/b|β-Team]]'''
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</div></td><td width="1%"><!-- spacing --></td><td width="34%" valign="top"><div style="background:#aaaaaa; padding:3px;">
-
*出力システム作成班
+
<!-- 右側コンテンツのタイトル -->
-
:*福冨浩樹 Hiroki Fukutomi
+
スケジュール
-
:*小林あおい Aoi Kobayashi
+
</div><div style="background:#dddddd;padding:5px;">
-
:*香取崇広 Takahiro Katori
+
<!-- 右側コンテンツの内容 -->
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:*井山佳美 Yoshimi Iyama
+
__NOTOC__
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+
=== 実験日程 ===
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[[Team:Chiba |Home]] / [[Team:Chiba/Internal |Internal]] / [[Team:Chiba/News|おしらせ]] / [[Team:Chiba/jk|実験ログ]] / [[Team:Chiba/Study|勉強会ログ]] / [[Team:Chiba/Meeting|Meeting]] / [[Team:Chiba/BS |BS]] / [[Team:Chiba/kk |考えてることを共有しようのページ]] / [[Team:Chiba/Graveyard|Graveyard]]
+
*'''17, August~'''
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より詳細な実験ノートは英語版カレンダーから参照できます。
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:*[[Team:Chiba/jk|日本語版実験ノート]]
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::[[Team:Chiba/jk/α|入力班]]
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::[[Team:Chiba/jk/β|送受信班]]
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::[[Team:Chiba/jk/γ|出力班]]
 +
:*[[Team:Chiba/protocol/j|プロトコル]]
 +
:*[[Team:Chiba/Reference/j|リファレンス]]
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 +
 
 +
 
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</div></td></tr></table>
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== 実験班 ==
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*''17, August ~ 13, September''
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{|class=wikitable align=center width=900
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!<big>入力班</big>
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!<big>通信班</big>
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!<big>出力班</big>
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[[User:Takahiro| 香取崇広]], [[User:Aoi| 小林あおい]]
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[[User:Kohei| 川崎浩平]], [[User:Yoshimi| 井山佳美]], [[User:Masahiro| 冨永将大]]
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[[User:Hiroki| 福冨浩樹]], [[User:Mai| 杉山まい]]
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*''13, September ~ 1, October''
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!<big>通信班</big>
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!<big>受信班</big>
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*''1, October~''
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{|class=wikitable align=center width=900
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!<big>受信班</big>
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!<big>受信側デモ班</big>
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!<big>送信側デモ班</big>
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[[User:Aoi| 小林あおい]], [[User:Hiroki| 福冨浩樹]]
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[[User:Kohei| 川崎浩平]], [[User:Takahiro| 香取崇広]]
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[[User:Yoshimi| 井山佳美]] 
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!align="center"|[[Team:Chiba/Parts/j|Parts Submitted to the Registry]]
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!align="center"|[[Team:Chiba/Modeling/j|モデリング]]
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スケジュール


実験日程

  • 17, August~

より詳細な実験ノートは英語版カレンダーから参照できます。

  • 日本語版実験ノート
入力班
送受信班
出力班



実験班

  • 17, August ~ 13, September
入力班 通信班 出力班

香取崇広, 小林あおい

川崎浩平, 井山佳美, 冨永将大

福冨浩樹, 杉山まい

  • 13, September ~ 1, October
通信班 受信班

川崎浩平, 井山佳美, 香取崇広, 冨永将大

福冨浩樹, 杉山まい, 小林あおい

  • 1, October~
受信班 受信側デモ班 送信側デモ班

小林あおい, 福冨浩樹

川崎浩平, 香取崇広

井山佳美


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