Team:Chiba/jk

From 2008.igem.org

(Difference between revisions)
(To Do List)
(実験日程)
 
(23 intermediate revisions not shown)
Line 1: Line 1:
-
>[[Team:Chiba/Internal |Notebook]]  
+
<html><link rel="stylesheet" href="https://2008.igem.org/wiki/index.php?title=User:Maiko/chiba.css&action=raw&ctype=text/css" type="text/css" /></html>
-
----
+
[[Image:Chiba-U.gif|center]]
 +
 
 +
{| style="color:white;" cellpadding="3" cellspacing="3" border="0" width="100%" align="center" class="menu" |
 +
!align="center"|[[Team:Chiba/j|ホーム]]
 +
!align="center"|[[Team:Chiba/Team/j|メンバー紹介]]
 +
!align="center"|[[Team:Chiba/Project/j|プロジェクト紹介]]
 +
!align="center"|[[Team:Chiba/Parts/j|Parts Submitted to the Registry]]
 +
!align="center"|[[Team:Chiba/Modeling/j|モデリング]]
 +
!align="center"|[[Team:Chiba/Internal|ノート]]
-
{| align="center"
 
-
|{{#calendar: year=2008 | month=08 | title=Team:Chiba/Calendar-Main}}
 
-
|{{#calendar: year=2008 | month=09 | title=Team:Chiba/Calendar-Main}}
 
-
|{{#calendar: year=2008 | month=10 | title=Team:Chiba/Calendar-Main}}
 
-
|{{#calendar: year=2008 | month=11 | title=Team:Chiba/Calendar-Main}}
 
-
|
 
|}
|}
 +
<table border=0 width="100%"><tr><td width="65%" valign="top"><div style="background:#aaaaaa;padding:3px;">
 +
<!-- 左側コンテンツのタイトル -->
 +
カレンダー
 +
</div><div style="background:#dddddd;padding:5px;">
 +
<!-- 左側コンテンツの内容 -->
-
----
+
{|  align="center"
 +
{| style="color:#0c6;" cellpadding="2" cellspacing="1" border="1" bordercolor="#800000" width="60%" align="center"
 +
!align="center"|{{#calendar: title=Team:Chiba/Calendar-Home |year=2008 | month=08}}
 +
!align="center"|{{#calendar: title=Team:Chiba/Calendar-Home |year=2008 | month=09}}
 +
|}
 +
{| style="color:#0c6;" cellpadding="2" cellspacing="1" border="1" bordercolor="#800000" width="60%" align="center"
 +
!align="center"|{{#calendar: title=Team:Chiba/Calendar-Home |year=2008 | month=10}}
 +
!align="center"|{{#calendar: title=Team:Chiba/Calendar-Home |year=2008 | month=11}}
 +
|}
-
==To Do List==
 
-
*出力の決定(杉山、福冨)
 
-
**LacZ-->基質濃度に依存
 
-
**rLuciferine-->見えない?-->基質が必要、光分解性(詳しく調べる)
 
-
*Rs,PFL(LuxR,J3720-->imperial,2006)の作成(杉山、福冨)
 
-
*入力の決定(香取)
 
-
**Arabinose promotor?
 
-
**On/Offの必要性は-->なし?
 
-
*Time-delayの確認(井山、川崎、小林、冨永)
 
-
**cinIのクローニング(井山、川崎)<Br>
 
-
**差を広げる-->温度、培地、替えてみる.PFL(Positive feedback loop)(BBa_37015)の利用.
 
-
**AHL固定(1nM,10nM,100nM~)
 
-
**固体培地にspot()
 
-
**His TagつきGFP(その他タンパク質)を発現-->freeze-->SDS-PAGE-->blotting
 
-
**Is(BW,XL10G)をT9002(BW)でdelay check
 
-
***さらに-BBa_J37020を形質転換(XL10G,BW)でtime-delayをチェック
 
-
*work out deal to print T-shirts (井山、福冨)
 
-
===still under discussion===
+
</div></td><td width="1%"><!-- spacing --></td><td width="34%" valign="top"><div style="background:#aaaaaa; padding:3px;">
-
*出力を交換できる形でクローニングしよう
+
<!-- 右側コンテンツのタイトル -->
-
*AHL synthase のkineticsについての情報は?
+
スケジュール
-
*ベクターの乗せ換え(PSB1-->P15A)(井山、小林、川崎)<Br>
+
</div><div style="background:#dddddd;padding:5px;">
-
----
+
<!-- 右側コンテンツの内容 -->
 +
__NOTOC__
-
=='''実験について(どこにおいたらいいか分からなかったので~不必要かも)'''==
 
-
===時間スイッチ作成===
 
-
発現時間の調節をするために、以下の要件が挙げられる。
+
=== 実験日程 ===
 +
*'''17, August~'''
 +
より詳細な実験ノートは英語版カレンダーから参照できます。
 +
:*[[Team:Chiba/jk|日本語版実験ノート]]
 +
::[[Team:Chiba/jk/α|入力班]]
 +
::[[Team:Chiba/jk/β|送受信班]]
 +
::[[Team:Chiba/jk/γ|出力班]]
 +
:*[[Team:Chiba/protocol/j|プロトコル]]
 +
:*[[Team:Chiba/Reference/j|リファレンス]]
-
#インデューサーの合成速度を下げる。<Br>RBSの調整(B0030-->B0033),コピー数の調整(5-->300)
 
-
#レセプタータンパク質の感度を下げる。<Br>クオラムセンシングのクロストークを利用する。生物によってAHL(Acyl-L-Homoserine Lactone)のアシル基が異なる([[Team:Chiba/Reference/j|ref.3]]).生物ごとのクオラムセンシングについては、[[Team:Chiba/Reference/j|ref.9]]参照.
 
-
*ex)(  )内はシンターゼ
 
-
**P.aeruginosa->C4-AHL(RhlI)
 
-
**V. fisheri->C6-3-oxo-AHL(LuxI)
 
-
**A.tumefaciens->C8-3-oxo-AHL(TraI)
 
-
**P.aeruginosa->C10-3-oxo-AHL(VanI)
 
-
**P.aeruginosa->C12-3-oxo-AHL(LasI)
 
-
**R.leguminosarum->C14-3-hydroxy-AHL(CinI)
 
-
'''Construction'''(From BioBrick)
 
-
:*Sender(Autoinducer synthase)
 
-
::LuxI,LasI,CinI,RhlI(lacプロモーター)
 
-
:*Receiver
 
-
::LuxR,LasR,CinR,RhlR
 
-
'''Cross-Talk Check'''
+
</div></td></tr></table>
-
#LuxR vs LuxI('''OK'''),LasI('''OK'''),CinI(?),RhlI('''OK''')
+
-
#LuxI vs LuxR,LasR,CinR,RhlR
+
-
 
+
-
'''RBS交換'''<Br>
+
-
*既存のパーツ
+
-
**B0034+luxI<Br>
+
-
*New parts(planning)
+
-
**B0033(weak)+luxI
+
-
**B0032(medium)+luxI
+
-
**B0031(weaker)+luxI
+
-
 
+
-
 
+
-
----
+
 +
== 実験班 ==
 +
*''17, August ~ 13, September''
{|class=wikitable align=center width=900
{|class=wikitable align=center width=900
-
 
+
!<big>入力班</big>
-
!<big>[[Team:Chiba/jk/α|入力班]]</big>
+
!<big>通信班</big>
-
!<big>[[Team:Chiba/jk/β|送受信班]]</big>
+
!<big>出力班</big>
-
!<big>[[Team:Chiba/jk/γ|出力班]]</big>
+
-
!<big>その他</big>
+
|-
|-
-
 
| align=center|
| align=center|
-
小林あおい Aoi Kobayashi
+
[[User:Takahiro| 香取崇広]], [[User:Aoi| 小林あおい]]
 +
| align=center|
 +
[[User:Kohei| 川崎浩平]], [[User:Yoshimi| 井山佳美]], [[User:Masahiro| 冨永将大]]
 +
| align=center|
 +
[[User:Hiroki| 福冨浩樹]], [[User:Mai| 杉山まい]]
 +
|}
-
香取崇広 Takahiro Katori
+
*''13, September ~ 1, October''
-
|align=center|
+
{|class=wikitable align=center width=900
-
冨永将大 Masahiro Tominaga
+
!<big>通信班</big>
 +
!<big>受信班</big>
 +
|-
-
川崎浩平 Kohei Kawasaki
 
-
 
-
井山佳美 Yoshimi Iyama
 
| align=center|
| align=center|
-
福冨浩樹 Hiroki Fukutomi
+
[[User:Kohei| 川崎浩平]], [[User:Yoshimi| 井山佳美]], [[User:Takahiro| 香取崇広]], [[User:Masahiro| 冨永将大]]
 +
| align=center|
 +
[[User:Hiroki| 福冨浩樹]], [[User:Mai| 杉山まい]], [[User:Aoi| 小林あおい]]
 +
|}
-
杉山まい Mai Sugiyama
+
*''1, October~''
 +
{|class=wikitable align=center width=900
 +
!<big>受信班</big>
 +
!<big>受信側デモ班</big>
 +
!<big>送信側デモ班</big>
 +
|-
| align=center|
| align=center|
-
*[[Team:Chiba/Reference/j|Reference]]
+
[[User:Aoi| 小林あおい]], [[User:Hiroki| 福冨浩樹]]  
-
*[[Team:Chiba/protocol|Protocols]]
+
| align=center|
-
*Inventory
+
[[User:Kohei| 川崎浩平]], [[User:Takahiro| 香取崇広]]  
-
*[[Team:Chiba/Ordering|Ordering]]
+
| align=center|
 +
[[User:Yoshimi| 井山佳美]]  
|}
|}
-
----
+
 
-
{| style="color:white;background-color:Maroon" cellpadding="3" cellspacing="3" border="1" bordercolor="white" width="100%" align="center"
+
{| style="color:white;" cellpadding="3" cellspacing="3" border="0" width="100%" align="center" class="menu" |
!align="center"|[[Team:Chiba/j|ホーム]]
!align="center"|[[Team:Chiba/j|ホーム]]
!align="center"|[[Team:Chiba/Team/j|メンバー紹介]]
!align="center"|[[Team:Chiba/Team/j|メンバー紹介]]
Line 110: Line 100:
!align="center"|[[Team:Chiba/Modeling/j|モデリング]]
!align="center"|[[Team:Chiba/Modeling/j|モデリング]]
!align="center"|[[Team:Chiba/Internal|ノート]]
!align="center"|[[Team:Chiba/Internal|ノート]]
 +
|}
|}

Latest revision as of 08:14, 14 December 2008

Chiba-U.gif

カレンダー

August
MTWTFSS
        1 2 3
4 5 6 7 8 9 10
11 12 13 14 15 16 17
18 19 20 21 22 23 24
25 26 27 28 29 30 31
September
MTWTFSS
1 2 3 4 5 6 7
8 9 10 11 12 13 14
15 16 17 18 19 20 21
22 23 24 25 26 27 28
29 30
October
MTWTFSS
    1 2 3 4 5
6 7 8 9 10 11 12
13 14 15 16 17 18 19
20 21 22 23 24 25 26
27 28 29 30 31
November
MTWTFSS
          1 2
3 4 5 6 7 8 9
10 11 12 13 14 15 16
17 18 19 20 21 22 23
24 25 26 27 28 29 30


スケジュール


実験日程

  • 17, August~

より詳細な実験ノートは英語版カレンダーから参照できます。

  • 日本語版実験ノート
入力班
送受信班
出力班



実験班

  • 17, August ~ 13, September
入力班 通信班 出力班

香取崇広, 小林あおい

川崎浩平, 井山佳美, 冨永将大

福冨浩樹, 杉山まい

  • 13, September ~ 1, October
通信班 受信班

川崎浩平, 井山佳美, 香取崇広, 冨永将大

福冨浩樹, 杉山まい, 小林あおい

  • 1, October~
受信班 受信側デモ班 送信側デモ班

小林あおい, 福冨浩樹

川崎浩平, 香取崇広

井山佳美